More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0969 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0878  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 
840 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00403234  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  100 
 
 
801 aa  1657    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 
812 aa  623  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 
803 aa  625  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1361  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 
912 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 
872 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2602  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
946 aa  557  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2040  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 
810 aa  544  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193503  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
862 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  32.69 
 
 
1062 aa  174  5e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1987  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
552 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2233  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
552 aa  172  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0296242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
557 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0622  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
753 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
551 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 
661 aa  171  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
701 aa  171  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.282736 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 
630 aa  170  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
671 aa  169  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1844  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
714 aa  169  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.257508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  39.2 
 
 
661 aa  168  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 
507 aa  167  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2729  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
702 aa  167  9e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.346218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
540 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1990  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
677 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.871736  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  38.63 
 
 
592 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 
552 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
711 aa  162  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.598881  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1776  histidine kinase  38.68 
 
 
519 aa  162  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
592 aa  162  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  31.36 
 
 
1061 aa  161  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
654 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0073  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
505 aa  160  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2038  histidine kinase  36.33 
 
 
552 aa  160  8e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
402 aa  160  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  28.91 
 
 
852 aa  160  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 
760 aa  159  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  35.47 
 
 
853 aa  159  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
970 aa  158  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
852 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 
819 aa  158  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 
801 aa  157  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  26.36 
 
 
556 aa  157  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  35.16 
 
 
394 aa  157  8e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
576 aa  156  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1356  histidine kinase  36.4 
 
 
591 aa  157  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
925 aa  157  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
523 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
523 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 
560 aa  156  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
557 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
516 aa  156  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  29.7 
 
 
567 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2189  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
726 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  36.13 
 
 
395 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
542 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
682 aa  154  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
520 aa  154  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1211  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
865 aa  154  8e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
544 aa  153  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  34.04 
 
 
866 aa  153  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  37.77 
 
 
587 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
394 aa  152  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
504 aa  152  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113715  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  38.26 
 
 
542 aa  151  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 
842 aa  151  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  39 
 
 
516 aa  151  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  31.69 
 
 
872 aa  151  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 
712 aa  150  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.7 
 
 
819 aa  150  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  39.57 
 
 
369 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  34.26 
 
 
313 aa  150  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2370  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
672 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2710  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
756 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.438958  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
495 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3565  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
641 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3371  histidine kinase  36.73 
 
 
887 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1349  histidine kinase  37.65 
 
 
554 aa  149  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134136  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4367  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 
800 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.522603  normal  0.113968 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  35.39 
 
 
673 aa  149  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.96 
 
 
541 aa  148  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
408 aa  149  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
903 aa  148  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2633  histidine kinase  34.44 
 
 
566 aa  148  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
906 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  38.7 
 
 
584 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  35.06 
 
 
903 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 
804 aa  148  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
588 aa  148  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0849  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
518 aa  148  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  27.98 
 
 
1561 aa  148  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2028  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.55 
 
 
1247 aa  148  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.138072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3869  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.59 
 
 
611 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.793663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
557 aa  147  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
566 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 
844 aa  147  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
1168 aa  147  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3718  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.04 
 
 
826 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.62 
 
 
1255 aa  147  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>