More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0602 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
711 aa  1453    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.598881  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2189  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.12 
 
 
726 aa  780    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2729  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.38 
 
 
702 aa  665    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.346218 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1990  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 
677 aa  628  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.871736  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.25 
 
 
701 aa  608  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.282736 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1222  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
686 aa  253  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583301 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0975  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
683 aa  251  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2370  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 
672 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
702 aa  232  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
671 aa  229  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.918325 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0622  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
753 aa  224  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
507 aa  193  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
862 aa  192  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3565  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
641 aa  192  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
682 aa  190  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.94 
 
 
1255 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
402 aa  188  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 
1428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 
1151 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.79 
 
 
819 aa  183  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.57 
 
 
819 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
567 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 
677 aa  179  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.9 
 
 
1121 aa  178  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 
660 aa  177  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  31.58 
 
 
410 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  28.78 
 
 
852 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2564  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
559 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382353  hitchhiker  0.0000221302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
673 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 
801 aa  174  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 
897 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 
983 aa  173  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 
804 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  40.08 
 
 
661 aa  173  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 
871 aa  173  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
408 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.88 
 
 
844 aa  171  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
852 aa  171  5e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
683 aa  170  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
544 aa  168  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
661 aa  168  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  39.92 
 
 
516 aa  167  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
592 aa  167  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  29.32 
 
 
1092 aa  167  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  36.18 
 
 
592 aa  166  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  29.87 
 
 
853 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0892  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
738 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.31 
 
 
541 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 
1180 aa  165  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
671 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 
662 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
560 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 
1140 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  37.7 
 
 
673 aa  163  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 
642 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 
1168 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  33.04 
 
 
801 aa  162  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
1260 aa  162  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 
1260 aa  160  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.18 
 
 
952 aa  160  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
514 aa  160  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 
1194 aa  160  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
853 aa  159  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.43 
 
 
776 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
842 aa  159  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
522 aa  158  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1985  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 
650 aa  158  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 
1322 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 
642 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 
817 aa  158  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
551 aa  158  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0835  histidine kinase  30.14 
 
 
418 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.882013  normal  0.0872609 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  36.48 
 
 
674 aa  157  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  36.04 
 
 
1061 aa  157  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
655 aa  157  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
1432 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
859 aa  157  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  34.06 
 
 
655 aa  156  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
970 aa  156  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
588 aa  156  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 
1191 aa  156  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  38.19 
 
 
1062 aa  156  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 
1132 aa  156  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  40.38 
 
 
912 aa  156  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 
1418 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
557 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 
773 aa  154  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1296  sensory box histidine kinase/response regulator  30.33 
 
 
726 aa  154  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00691779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
542 aa  154  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 
759 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  30.12 
 
 
1561 aa  154  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1192  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.64 
 
 
912 aa  154  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1844  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
714 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.257508  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  32.8 
 
 
621 aa  153  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 
647 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
516 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 
1139 aa  152  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
849 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 
822 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.5 
 
 
1148 aa  152  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>