More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2028 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3002  multi-sensor hybrid histidine kinase  63.93 
 
 
1234 aa  1492    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2028  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1247 aa  2496    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.138072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 
819 aa  315  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.8 
 
 
819 aa  312  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
804 aa  259  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 
801 aa  250  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  27 
 
 
1132 aa  238  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.76 
 
 
844 aa  238  7e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 
853 aa  230  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
842 aa  230  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
551 aa  228  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
859 aa  224  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  28.14 
 
 
1092 aa  224  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
642 aa  219  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
777 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.69 
 
 
522 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 
637 aa  215  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 
796 aa  214  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.7 
 
 
952 aa  213  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
922 aa  213  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
668 aa  211  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 
557 aa  211  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  31.6 
 
 
1112 aa  209  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 
845 aa  209  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  30.46 
 
 
1015 aa  209  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
845 aa  207  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 
796 aa  206  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
819 aa  206  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.78 
 
 
1322 aa  204  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 
630 aa  204  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 
849 aa  203  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1985  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
650 aa  202  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 
743 aa  202  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  32.62 
 
 
812 aa  202  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1525  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
872 aa  202  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40409  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
874 aa  202  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
670 aa  201  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
867 aa  202  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  27.89 
 
 
1379 aa  201  6e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 
657 aa  201  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
766 aa  201  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  34.33 
 
 
945 aa  200  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  34.7 
 
 
866 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.65 
 
 
1258 aa  198  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  28.19 
 
 
737 aa  198  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.86 
 
 
853 aa  198  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
867 aa  198  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00129243  normal  0.0294734 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
888 aa  197  8.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  34.08 
 
 
945 aa  197  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 
880 aa  197  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
857 aa  197  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  33.58 
 
 
872 aa  197  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.44 
 
 
885 aa  197  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 
962 aa  196  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.59 
 
 
1279 aa  196  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 
1222 aa  196  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 
927 aa  195  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 
751 aa  195  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  33.76 
 
 
1561 aa  194  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 
774 aa  194  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 
951 aa  195  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.09 
 
 
1262 aa  194  6e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 
643 aa  193  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0319  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.67 
 
 
824 aa  193  2e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.655044  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 
847 aa  193  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 
652 aa  193  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 
810 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  34.27 
 
 
733 aa  192  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 
803 aa  192  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 
793 aa  191  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 
1016 aa  191  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 
702 aa  191  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 
639 aa  191  8e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 
695 aa  191  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 
663 aa  191  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 
1134 aa  191  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 
926 aa  190  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.72 
 
 
641 aa  191  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.44 
 
 
660 aa  190  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 
857 aa  190  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
766 aa  189  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 
1106 aa  189  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 
817 aa  189  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
664 aa  189  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
770 aa  189  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  34.21 
 
 
749 aa  189  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  28.71 
 
 
1258 aa  189  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 
736 aa  189  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.87 
 
 
656 aa  189  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2766  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 
717 aa  189  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.947572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
650 aa  189  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
1215 aa  188  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 
873 aa  188  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 
752 aa  187  9e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 
1011 aa  187  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  33.25 
 
 
654 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.91 
 
 
1148 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
925 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 
677 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  34.9 
 
 
594 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>