More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2019 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1016 aa  2047    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3910  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
850 aa  351  4e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.302032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0852  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
1055 aa  292  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1697  histidine kinase  41.89 
 
 
505 aa  258  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3521  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
1022 aa  257  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1908  histidine kinase  33.87 
 
 
772 aa  236  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0199543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0867  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 
905 aa  226  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.768776  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 
622 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.28 
 
 
844 aa  214  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  36.46 
 
 
1561 aa  213  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
628 aa  210  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  36.18 
 
 
622 aa  209  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
622 aa  209  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
1124 aa  207  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
822 aa  204  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
557 aa  203  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
873 aa  201  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1985  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
650 aa  201  7e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
576 aa  200  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 
842 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 
571 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
846 aa  199  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0247  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 
870 aa  199  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136851  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 
819 aa  198  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1175  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 
821 aa  197  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.07 
 
 
819 aa  195  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
670 aa  195  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
869 aa  195  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 
1428 aa  194  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0486  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 
837 aa  194  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000590544 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  33.25 
 
 
845 aa  193  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 
571 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 
712 aa  192  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  35.98 
 
 
678 aa  191  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 
766 aa  192  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  31.88 
 
 
527 aa  191  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 
793 aa  191  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 
736 aa  191  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 
869 aa  190  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  33.51 
 
 
749 aa  189  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 
575 aa  189  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 
817 aa  189  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
857 aa  189  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3245  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.5 
 
 
860 aa  188  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48627  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
888 aa  187  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5110  histidine kinase  37.34 
 
 
558 aa  187  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  0.0814675 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.25 
 
 
916 aa  187  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  32.12 
 
 
646 aa  187  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
766 aa  187  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 
817 aa  187  8e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
1275 aa  187  9e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  32.13 
 
 
594 aa  187  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 
660 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.86 
 
 
1018 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 
926 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 
1419 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 
1309 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 
823 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 
925 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 
759 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 
559 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1428  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
691 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123829  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 
999 aa  185  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  33.5 
 
 
1112 aa  186  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 
981 aa  186  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
639 aa  185  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 
1039 aa  185  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2028  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 
1247 aa  185  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.138072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 
654 aa  185  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 
1034 aa  185  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  33.06 
 
 
525 aa  185  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 
713 aa  184  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 
743 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.9 
 
 
1328 aa  184  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 
853 aa  184  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
962 aa  184  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
703 aa  184  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 
1279 aa  184  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0848  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 
698 aa  184  8.000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132769  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
728 aa  184  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
770 aa  184  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  32.36 
 
 
646 aa  184  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
766 aa  184  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0297  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 
711 aa  184  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.219152  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 
1418 aa  184  9.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
845 aa  184  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 
673 aa  183  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 
935 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
653 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1620  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.95 
 
 
927 aa  183  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2532  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 
794 aa  183  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.108241  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4629  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
841 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 
1176 aa  183  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
686 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 
1260 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 
983 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  33.5 
 
 
1379 aa  181  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 
650 aa  181  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 
1184 aa  182  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  34.95 
 
 
575 aa  182  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.396925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>