More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1443 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 
654 aa  1333    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  53.55 
 
 
656 aa  688    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  64.83 
 
 
654 aa  837    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  50.39 
 
 
525 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.52 
 
 
1047 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.35 
 
 
1113 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.61 
 
 
1108 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.04 
 
 
1047 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.97 
 
 
1279 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.24 
 
 
661 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  50.13 
 
 
844 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.23 
 
 
1322 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.91 
 
 
645 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.38 
 
 
1260 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.65 
 
 
1260 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.82 
 
 
983 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.26 
 
 
664 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.9 
 
 
692 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.39 
 
 
692 aa  365  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.22 
 
 
663 aa  364  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.61 
 
 
673 aa  362  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.57 
 
 
677 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.21 
 
 
953 aa  353  8e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0486  GAF sensor hybrid histidine kinase  46.72 
 
 
837 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000590544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.74 
 
 
1132 aa  345  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.36 
 
 
642 aa  340  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.6 
 
 
796 aa  339  9e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.51 
 
 
650 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.33 
 
 
642 aa  335  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.36 
 
 
796 aa  334  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 
1102 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.29 
 
 
1079 aa  326  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.24 
 
 
1106 aa  325  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.56 
 
 
819 aa  323  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.77 
 
 
766 aa  323  9.000000000000001e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 
962 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 
751 aa  320  5e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.16 
 
 
859 aa  318  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  42.71 
 
 
824 aa  317  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.31 
 
 
849 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.33 
 
 
853 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
753 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.11 
 
 
817 aa  314  3.9999999999999997e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 
828 aa  313  7.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.36 
 
 
777 aa  311  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 
1176 aa  311  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 
773 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 
736 aa  310  4e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 
773 aa  310  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 
769 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 
1180 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3045  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.85 
 
 
954 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.34 
 
 
955 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
752 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 
845 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  44.62 
 
 
749 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  44.7 
 
 
733 aa  306  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 
639 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  43.96 
 
 
527 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1847  histidine kinase  43.5 
 
 
785 aa  304  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.36 
 
 
845 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.76 
 
 
557 aa  303  5.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.94 
 
 
955 aa  302  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  40.53 
 
 
676 aa  301  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.47 
 
 
1134 aa  300  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.86 
 
 
885 aa  296  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.09 
 
 
822 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  39.76 
 
 
676 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 
1018 aa  294  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.28 
 
 
1021 aa  293  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.58 
 
 
522 aa  293  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.06 
 
 
845 aa  292  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.42 
 
 
711 aa  291  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 
637 aa  292  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.84 
 
 
897 aa  292  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.09 
 
 
864 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  38.46 
 
 
571 aa  291  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  40.99 
 
 
866 aa  290  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.37 
 
 
740 aa  290  6e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  41.3 
 
 
1112 aa  287  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.06 
 
 
741 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1296  sensory box histidine kinase/response regulator  41.19 
 
 
726 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00691779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0515  GAF sensor signal transduction histidine kinase  54.32 
 
 
689 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.23 
 
 
994 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  55.14 
 
 
689 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0334119  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  41.95 
 
 
726 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 
857 aa  283  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.42 
 
 
641 aa  284  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 
926 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 
668 aa  283  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  40.61 
 
 
945 aa  283  9e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  39.85 
 
 
1015 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.39 
 
 
727 aa  282  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2780  histidine kinase  40.86 
 
 
558 aa  281  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 
546 aa  281  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00154548  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 
880 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 
823 aa  280  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 
812 aa  280  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
1124 aa  280  9e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  40.36 
 
 
945 aa  279  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>