More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3045 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3045  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 954 aa  1967    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011876  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.08 
 
 		 1260 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.21 
 
 		 1260 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.51 
 
 		 650 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.62 
 
 		 769 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 		 773 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 		 773 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 		 853 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 		 859 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 		 1322 aa  345  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 1279 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.7 
 
 		 645 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  43.63 
 
 		 525 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 661 aa  328  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 		 664 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 		 1047 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 663 aa  314  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 		 642 aa  312  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.35 
 
 		 656 aa  310  8e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.55 
 
 		 677 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 953 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.28 
 
 		 983 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.05 
 
 		 1113 aa  308  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  42.38 
 
 		 654 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.2 
 
 		 1047 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 673 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.5 
 
 		 1108 aa  302  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  42.78 
 
 		 654 aa  301  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 		 692 aa  300  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 		 1132 aa  300  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 557 aa  297  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 		 692 aa  295  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 1079 aa  288  4e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 991 aa  287  5.999999999999999e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  34.98 
 
 		 844 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 		 864 aa  283  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 796 aa  281  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 		 897 aa  280  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 776 aa  279  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 822 aa  278  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  34.67 
 
 		 544 aa  277  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 796 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 962 aa  273  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 853 aa  271  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 		 639 aa  270  8e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  33.2 
 
 		 541 aa  268  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  33.2 
 
 		 541 aa  268  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  33.07 
 
 		 541 aa  267  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 		 1134 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  40.62 
 
 		 824 aa  267  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  39.18 
 
 		 749 aa  266  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 		 637 aa  264  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0486  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 		 837 aa  264  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000590544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 		 1021 aa  262  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 		 1106 aa  262  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 		 641 aa  261  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 		 657 aa  260  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 888 aa  259  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  32.87 
 
 		 534 aa  259  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  39.76 
 
 		 733 aa  259  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  33.67 
 
 		 533 aa  258  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 		 642 aa  258  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 		 840 aa  258  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.71 
 
 		 1418 aa  258  4e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  32.29 
 
 		 539 aa  257  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 		 770 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 819 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  33.47 
 
 		 533 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 845 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  51.87 
 
 		 689 aa  255  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0334119  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1866  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 649 aa  255  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 1018 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 		 751 aa  254  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 		 885 aa  253  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 874 aa  253  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 		 845 aa  253  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  32.3 
 
 		 1112 aa  252  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 		 770 aa  252  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 849 aa  252  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.24 
 
 		 714 aa  251  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0515  GAF sensor signal transduction histidine kinase  51.45 
 
 		 689 aa  251  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 642 aa  251  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.66 
 
 		 803 aa  251  6e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 1102 aa  251  6e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  33.8 
 
 		 527 aa  251  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1039  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 		 798 aa  251  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 		 766 aa  250  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  36.85 
 
 		 945 aa  249  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.6 
 
 		 857 aa  250  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 		 857 aa  249  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 1050 aa  249  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 		 817 aa  249  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 766 aa  248  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 660 aa  248  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 770 aa  248  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3222  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 		 798 aa  247  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.150716 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  36.62 
 
 		 945 aa  246  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  36.47 
 
 		 866 aa  246  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 828 aa  246  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 955 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>