More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1138 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  50.53 
 
 		 945 aa  807    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1525  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.53 
 
 		 872 aa  776    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.25 
 
 		 925 aa  822    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 888 aa  1792    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.12 
 
 		 867 aa  747    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00129243  normal  0.0294734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  50.74 
 
 		 903 aa  811    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5149  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.89 
 
 		 869 aa  820    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  78.5 
 
 		 880 aa  1316    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.78 
 
 		 867 aa  758    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  48.12 
 
 		 872 aa  749    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  80.91 
 
 		 874 aa  1337    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  77.61 
 
 		 853 aa  1300    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.88 
 
 		 857 aa  802    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  76.27 
 
 		 892 aa  1339    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.81 
 
 		 847 aa  815    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1700  multi-sensor hybrid histidine kinase  81.15 
 
 		 850 aa  1316    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.99866 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  50.41 
 
 		 945 aa  804    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.82 
 
 		 906 aa  818    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  92.24 
 
 		 853 aa  1555    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.58 
 
 		 890 aa  810    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  51.01 
 
 		 866 aa  793    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.73 
 
 		 903 aa  813    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3527  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.47 
 
 		 839 aa  803    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.064663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.9 
 
 		 840 aa  593  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.45 
 
 		 857 aa  545  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  36.96 
 
 		 845 aa  538  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  38.6 
 
 		 829 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.47 
 
 		 793 aa  419  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 		 853 aa  408  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.11 
 
 		 803 aa  403  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 770 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 766 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 		 811 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  47.13 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.37 
 
 		 766 aa  389  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1228  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 769 aa  386  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0595  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.28 
 
 		 680 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0755  sensor histidine kinase/response regulator  40.86 
 
 		 828 aa  380  1e-104  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0319  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40.86 
 
 		 824 aa  376  1e-102  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.655044  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.17 
 
 		 752 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1644  histidine kinase  50.13 
 
 		 779 aa  366  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000228151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1385  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.43 
 
 		 695 aa  360  8e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  46.55 
 
 		 749 aa  337  5.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  37.38 
 
 		 1112 aa  335  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.5 
 
 		 1132 aa  334  6e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  46.06 
 
 		 733 aa  331  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 769 aa  330  9e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.72 
 
 		 557 aa  323  9.000000000000001e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.94 
 
 		 962 aa  318  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.88 
 
 		 639 aa  317  8e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.38 
 
 		 845 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.43 
 
 		 1176 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 		 1134 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 766 aa  314  4.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 		 1079 aa  311  4e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 		 859 aa  311  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 650 aa  311  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  32.62 
 
 		 1561 aa  310  5.9999999999999995e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.38 
 
 		 845 aa  310  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  42.08 
 
 		 824 aa  308  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.99 
 
 		 796 aa  308  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 853 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.08 
 
 		 1180 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 		 1106 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  41.28 
 
 		 573 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 		 668 aa  304  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 		 796 aa  301  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 		 823 aa  301  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 		 661 aa  300  9e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 548 aa  298  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 		 657 aa  297  7e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.55 
 
 		 819 aa  296  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 		 849 aa  296  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.66 
 
 		 600 aa  296  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  38.62 
 
 		 1015 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 		 953 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 		 1102 aa  295  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 		 773 aa  295  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.32 
 
 		 751 aa  295  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 		 522 aa  295  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  39.56 
 
 		 525 aa  293  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.03 
 
 		 1039 aa  293  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 		 773 aa  292  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.5 
 
 		 1076 aa  292  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  40.25 
 
 		 571 aa  291  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.4 
 
 		 983 aa  290  7e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.93 
 
 		 922 aa  289  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.14 
 
 		 637 aa  289  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 		 1148 aa  289  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 925 aa  288  4e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 		 753 aa  287  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  40.2 
 
 		 1065 aa  287  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 1260 aa  286  8e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 		 1260 aa  286  9e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.59 
 
 		 777 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 1034 aa  286  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 		 752 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 		 551 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2652  histidine kinase  39.95 
 
 		 556 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 864 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>