More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1983 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  49.48 
 
 		 945 aa  763    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.3 
 
 		 867 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.34 
 
 		 840 aa  640    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 847 aa  1706    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1525  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.35 
 
 		 872 aa  699    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  50.47 
 
 		 892 aa  806    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.98 
 
 		 903 aa  748    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  51.81 
 
 		 888 aa  806    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.53 
 
 		 867 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00129243  normal  0.0294734 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  49.36 
 
 		 945 aa  760    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  45.65 
 
 		 872 aa  672    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.24 
 
 		 874 aa  796    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.35 
 
 		 853 aa  809    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.69 
 
 		 890 aa  763    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1700  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.06 
 
 		 850 aa  762    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.99866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3527  multi-sensor hybrid histidine kinase  62.89 
 
 		 839 aa  951    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.064663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.23 
 
 		 853 aa  807    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.83 
 
 		 880 aa  757    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  49.54 
 
 		 866 aa  771    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5149  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.21 
 
 		 869 aa  764    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  48.93 
 
 		 903 aa  746    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.59 
 
 		 857 aa  769    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.32 
 
 		 906 aa  751    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.11 
 
 		 925 aa  768    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.09 
 
 		 857 aa  534  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  37.17 
 
 		 845 aa  531  1e-149  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  40.38 
 
 		 829 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 853 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.87 
 
 		 803 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.36 
 
 		 793 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 811 aa  393  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.72 
 
 		 752 aa  395  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0319  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40.51 
 
 		 824 aa  387  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.655044  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  53.08 
 
 		 766 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1228  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.32 
 
 		 769 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.08 
 
 		 770 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0755  sensor histidine kinase/response regulator  40.62 
 
 		 828 aa  385  1e-105  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0595  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.08 
 
 		 680 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  52.48 
 
 		 766 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1644  histidine kinase  45.49 
 
 		 779 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000228151 
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  45.79 
 
 		 417 aa  360  7e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1385  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 695 aa  340  5.9999999999999996e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  41.11 
 
 		 733 aa  338  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 557 aa  333  9e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  40.51 
 
 		 749 aa  327  5e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.27 
 
 		 1132 aa  321  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 		 769 aa  321  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  36.56 
 
 		 1561 aa  313  6.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.62 
 
 		 639 aa  311  4e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  37.86 
 
 		 1112 aa  310  9e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 		 650 aa  309  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.38 
 
 		 766 aa  309  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.01 
 
 		 1176 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0366  sensor histidine kinase/response regulator  38.15 
 
 		 742 aa  299  1e-79  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  41.03 
 
 		 824 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 		 962 aa  298  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 		 1079 aa  299  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.72 
 
 		 845 aa  298  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.99 
 
 		 751 aa  298  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  41.32 
 
 		 1015 aa  298  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 853 aa  297  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.23 
 
 		 845 aa  296  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.93 
 
 		 522 aa  296  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.31 
 
 		 823 aa  296  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 859 aa  295  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 		 796 aa  293  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 1102 aa  292  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 673 aa  290  6e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 1134 aa  290  9e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.12 
 
 		 1076 aa  290  9e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  32.55 
 
 		 844 aa  288  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 661 aa  286  8e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 		 819 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 1115 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  41.26 
 
 		 527 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.19 
 
 		 753 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 		 796 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.86 
 
 		 1106 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  40.76 
 
 		 676 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  40.05 
 
 		 676 aa  283  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 		 773 aa  283  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 		 1260 aa  283  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 		 1260 aa  282  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 711 aa  282  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.21 
 
 		 1180 aa  282  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 		 849 aa  282  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  42.82 
 
 		 573 aa  282  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 		 1034 aa  281  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 773 aa  281  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.3 
 
 		 752 aa  280  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 		 641 aa  278  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.3 
 
 		 548 aa  278  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 777 aa  278  4e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 		 955 aa  277  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2652  histidine kinase  41.03 
 
 		 556 aa  277  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0849  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.57 
 
 		 518 aa  277  6e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 1053 aa  277  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.48 
 
 		 983 aa  276  8e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.9 
 
 		 926 aa  276  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 		 1105 aa  276  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0846765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>