More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3671 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  71.61 
 
 		 1039 aa  1518    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1034 aa  2101    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.87 
 
 		 793 aa  361  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 		 1102 aa  343  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 		 1079 aa  340  5.9999999999999996e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  32.72 
 
 		 1112 aa  334  5e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 		 1134 aa  331  4e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.75 
 
 		 777 aa  330  8e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 962 aa  328  4.0000000000000003e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.87 
 
 		 637 aa  322  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.22 
 
 		 1180 aa  322  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 		 1051 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.62 
 
 		 557 aa  321  3.9999999999999996e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 		 823 aa  318  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 		 828 aa  317  6e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  42.47 
 
 		 1015 aa  317  7e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.71 
 
 		 1176 aa  317  7e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 		 639 aa  317  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 		 1132 aa  315  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 1106 aa  314  3.9999999999999997e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 		 845 aa  313  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  43.41 
 
 		 527 aa  313  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.96 
 
 		 845 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 925 aa  311  4e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42 
 
 		 752 aa  311  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.12 
 
 		 641 aa  310  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 		 1148 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  43.62 
 
 		 824 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.45 
 
 		 1124 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.61 
 
 		 766 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 		 753 aa  302  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  40.93 
 
 		 892 aa  302  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.95 
 
 		 857 aa  301  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  41.85 
 
 		 945 aa  300  9e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  41.44 
 
 		 945 aa  298  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.08 
 
 		 853 aa  299  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.4 
 
 		 1126 aa  298  3e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.48 
 
 		 773 aa  297  7e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 		 1115 aa  297  9e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.42 
 
 		 751 aa  297  9e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 		 663 aa  296  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  42.82 
 
 		 594 aa  296  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.1 
 
 		 773 aa  296  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 		 1113 aa  295  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.08 
 
 		 664 aa  295  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.21 
 
 		 713 aa  295  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  40.1 
 
 		 866 aa  295  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 859 aa  295  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.77 
 
 		 769 aa  293  8e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.59 
 
 		 857 aa  293  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 		 819 aa  293  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.07 
 
 		 661 aa  292  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 		 874 aa  290  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 		 650 aa  290  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.1 
 
 		 796 aa  290  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 		 551 aa  290  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 660 aa  290  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1350  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.75 
 
 		 699 aa  289  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  43.93 
 
 		 1561 aa  289  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 849 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3527  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 		 839 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.064663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 		 642 aa  288  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 657 aa  287  8e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 853 aa  287  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 888 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.81 
 
 		 766 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 		 796 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 642 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.92 
 
 		 831 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  43.81 
 
 		 766 aa  285  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 793 aa  285  4.0000000000000003e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.81 
 
 		 770 aa  285  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 		 994 aa  284  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 		 953 aa  284  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.44 
 
 		 853 aa  283  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 		 677 aa  283  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 774 aa  282  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 		 847 aa  281  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.53 
 
 		 880 aa  281  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.59 
 
 		 1108 aa  281  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 		 1322 aa  281  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1296  sensory box histidine kinase/response regulator  36.94 
 
 		 726 aa  280  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00691779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  42.56 
 
 		 749 aa  280  9e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  35.59 
 
 		 845 aa  280  9e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 		 955 aa  280  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 		 955 aa  280  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 673 aa  280  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1644  histidine kinase  41.48 
 
 		 779 aa  278  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000228151 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 		 670 aa  278  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0872  histidine kinase  38.78 
 
 		 585 aa  278  5e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1847  histidine kinase  42.22 
 
 		 785 aa  278  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1700  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.99 
 
 		 850 aa  277  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.99866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 		 692 aa  277  7e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 885 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  39.85 
 
 		 733 aa  275  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.46 
 
 		 1260 aa  274  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 736 aa  273  9e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.33 
 
 		 740 aa  273  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 		 668 aa  273  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 692 aa  273  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>