More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1296 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1296  sensory box histidine kinase/response regulator  100 
 
 		 726 aa  1472    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00691779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.38 
 
 		 796 aa  365  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 		 1180 aa  361  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 		 859 aa  360  4e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41 
 
 		 962 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 		 853 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 		 1134 aa  354  4e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 		 796 aa  353  5e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.55 
 
 		 845 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.02 
 
 		 1079 aa  352  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.04 
 
 		 819 aa  351  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.19 
 
 		 849 aa  345  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.86 
 
 		 845 aa  345  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  40.41 
 
 		 1015 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.55 
 
 		 777 aa  335  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 		 955 aa  334  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 		 1148 aa  334  4e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.5 
 
 		 753 aa  331  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 		 752 aa  332  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.32 
 
 		 955 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.5 
 
 		 1176 aa  327  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 		 1279 aa  327  6e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 		 1322 aa  325  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.01 
 
 		 1106 aa  324  4e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.13 
 
 		 1124 aa  321  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 		 677 aa  320  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  35.58 
 
 		 1112 aa  317  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 		 1102 aa  317  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 		 885 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 1051 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.5 
 
 		 994 aa  312  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 		 673 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.88 
 
 		 773 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 		 557 aa  309  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.38 
 
 		 773 aa  308  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  45.43 
 
 		 733 aa  307  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 		 769 aa  302  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  45.92 
 
 		 527 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.89 
 
 		 823 aa  301  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 		 650 aa  296  7e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 		 661 aa  296  9e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 		 1126 aa  295  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 766 aa  293  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 		 637 aa  293  6e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.4 
 
 		 925 aa  293  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1260 aa  293  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  43.66 
 
 		 824 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  45.17 
 
 		 749 aa  292  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1260 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 		 1132 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 828 aa  291  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 		 983 aa  289  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  42.74 
 
 		 844 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 		 642 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.52 
 
 		 645 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 1115 aa  283  7.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  41.05 
 
 		 654 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 		 642 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  41.35 
 
 		 594 aa  282  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 		 1034 aa  281  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 522 aa  280  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 		 641 aa  280  7e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 		 943 aa  280  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 		 643 aa  280  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1108 aa  280  8e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  31.97 
 
 		 949 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 1113 aa  280  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 949 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1350  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 699 aa  276  7e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 		 740 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  40.1 
 
 		 571 aa  275  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.61 
 
 		 1021 aa  275  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.57 
 
 		 822 aa  274  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 		 736 aa  273  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 		 888 aa  273  7e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.56 
 
 		 692 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.22 
 
 		 1047 aa  272  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 		 551 aa  272  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  39.43 
 
 		 726 aa  272  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.03 
 
 		 857 aa  271  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 926 aa  271  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.18 
 
 		 664 aa  271  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  40.38 
 
 		 573 aa  271  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  36.43 
 
 		 490 aa  270  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.84 
 
 		 692 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 		 1054 aa  270  8e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.27 
 
 		 663 aa  268  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 		 657 aa  267  5e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 		 1047 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 		 953 aa  266  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 		 741 aa  266  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 656 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  33.52 
 
 		 646 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 		 793 aa  265  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 		 789 aa  264  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 		 853 aa  264  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 		 732 aa  264  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  38.78 
 
 		 654 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 		 853 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  34.29 
 
 		 1036 aa  263  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>