More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2145 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1124 aa  2312    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.78 
 
 		 823 aa  618  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.7 
 
 		 925 aa  593  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.3 
 
 		 1126 aa  542  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1350  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.3 
 
 		 699 aa  530  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 		 1148 aa  503  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0848  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 		 698 aa  488  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132769  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.97 
 
 		 817 aa  476  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 		 1106 aa  444  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 1079 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.81 
 
 		 962 aa  423  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.17 
 
 		 1180 aa  422  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 		 777 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 		 845 aa  416  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  51.78 
 
 		 1015 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 845 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51 
 
 		 1134 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 		 1176 aa  398  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.55 
 
 		 994 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.81 
 
 		 753 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.93 
 
 		 752 aa  392  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.36 
 
 		 1102 aa  383  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.86 
 
 		 1115 aa  383  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.24 
 
 		 1051 aa  375  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  49.09 
 
 		 1112 aa  364  6e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0872  histidine kinase  47.61 
 
 		 585 aa  351  4e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 853 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  44.76 
 
 		 594 aa  342  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  32.12 
 
 		 824 aa  340  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.8 
 
 		 650 aa  340  7e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 		 859 aa  337  7e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.64 
 
 		 1132 aa  336  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 769 aa  336  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.27 
 
 		 849 aa  327  6e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 		 796 aa  327  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 		 983 aa  325  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 		 796 aa  322  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.87 
 
 		 819 aa  322  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 1021 aa  321  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1296  sensory box histidine kinase/response regulator  45.12 
 
 		 726 aa  319  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00691779  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 		 817 aa  317  9e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 773 aa  316  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.5 
 
 		 557 aa  315  3.9999999999999997e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  44.65 
 
 		 733 aa  313  7.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1093  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 684 aa  313  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00117415  normal  0.649977 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.24 
 
 		 1322 aa  312  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.24 
 
 		 1279 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  43.91 
 
 		 527 aa  310  6.999999999999999e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 		 773 aa  310  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 673 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.72 
 
 		 955 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 834 aa  307  9.000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 		 677 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.45 
 
 		 1034 aa  306  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  32.76 
 
 		 749 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.93 
 
 		 955 aa  303  9e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.25 
 
 		 885 aa  302  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 639 aa  301  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 		 1260 aa  299  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.59 
 
 		 766 aa  299  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 		 1113 aa  298  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 		 1260 aa  298  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 		 1054 aa  297  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 		 727 aa  298  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.15 
 
 		 740 aa  297  9e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 		 692 aa  297  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  41.71 
 
 		 654 aa  294  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  40.36 
 
 		 726 aa  293  8e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.4 
 
 		 692 aa  293  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 		 999 aa  292  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.56 
 
 		 793 aa  292  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 		 661 aa  293  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 943 aa  290  8e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 		 828 aa  289  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.58 
 
 		 741 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.66 
 
 		 1108 aa  288  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  32.3 
 
 		 812 aa  288  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  36.26 
 
 		 571 aa  287  7e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.81 
 
 		 953 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 		 751 aa  286  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 		 1039 aa  285  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 		 551 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  39.18 
 
 		 1561 aa  285  4.0000000000000003e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 		 657 aa  284  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.3 
 
 		 1047 aa  285  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.01 
 
 		 663 aa  284  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 		 622 aa  284  6.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5205  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.98 
 
 		 727 aa  284  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 664 aa  283  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  41.07 
 
 		 844 aa  281  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 668 aa  281  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 		 1018 aa  281  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.87 
 
 		 857 aa  280  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 656 aa  280  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 		 840 aa  279  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  37.93 
 
 		 573 aa  278  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3222  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 798 aa  278  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.150716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4076  histidine kinase  41.39 
 
 		 416 aa  278  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  38.5 
 
 		 945 aa  278  5e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 		 810 aa  277  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>