More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3026 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.03 
 
 
801 aa  816    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.55 
 
 
804 aa  864    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 
819 aa  1657    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  87.8 
 
 
819 aa  1422    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  36.72 
 
 
1092 aa  318  2e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2028  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 
1247 aa  311  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.138072 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  36.46 
 
 
1379 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
1262 aa  310  9e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.32 
 
 
842 aa  306  8.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.56 
 
 
844 aa  303  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.48 
 
 
1258 aa  293  1e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  34.67 
 
 
737 aa  292  2e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.63 
 
 
952 aa  292  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  35.67 
 
 
1258 aa  288  4e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3002  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
1234 aa  286  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 
1132 aa  273  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.21 
 
 
1168 aa  270  7e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
666 aa  259  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.518725  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.89 
 
 
544 aa  257  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  35.9 
 
 
853 aa  251  4e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.34 
 
 
1651 aa  250  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 
817 aa  248  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 
652 aa  247  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
852 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 
1631 aa  241  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  37.97 
 
 
1061 aa  240  9e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 
1426 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  36.13 
 
 
852 aa  239  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 
962 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 
714 aa  238  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  38.86 
 
 
912 aa  237  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.77 
 
 
1255 aa  236  9e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.02 
 
 
1646 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5744  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
510 aa  236  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.36 
 
 
769 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 
695 aa  234  7.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
637 aa  233  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
1509 aa  233  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 
1215 aa  233  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 
922 aa  230  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  29.74 
 
 
1112 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 
642 aa  230  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 
1134 aa  228  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 
796 aa  225  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 
926 aa  225  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
953 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 
1309 aa  224  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  38.02 
 
 
1062 aa  224  7e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 
990 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
673 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 
642 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 
551 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 
1279 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 
557 aa  221  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  46.12 
 
 
516 aa  220  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 
766 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 
770 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 
796 aa  219  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 
803 aa  219  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 
1034 aa  219  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 
859 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 
643 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
864 aa  218  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
557 aa  218  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 
642 aa  218  5e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
1322 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
560 aa  217  7e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
552 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  36.04 
 
 
1561 aa  216  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
677 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
1122 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
802 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 
692 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4350  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 
686 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 
1079 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.08 
 
 
541 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
628 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 
614 aa  214  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 
622 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.66 
 
 
759 aa  214  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 
622 aa  213  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.87 
 
 
1113 aa  213  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 
670 aa  213  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  31.1 
 
 
622 aa  213  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
557 aa  213  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  32.14 
 
 
892 aa  213  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2970  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 
584 aa  212  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653031  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.61 
 
 
640 aa  212  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
559 aa  212  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 
936 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 
853 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 
926 aa  212  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
552 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
571 aa  211  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
1415 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 
660 aa  211  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 
766 aa  211  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 
647 aa  211  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
888 aa  211  6e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
810 aa  211  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>