More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2402 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2602  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.9 
 
 
946 aa  790    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0878  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 
840 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00403234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
803 aa  1637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.87 
 
 
872 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  43.02 
 
 
801 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 
812 aa  593  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1361  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 
912 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2040  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
810 aa  535  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193503  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
862 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
402 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
970 aa  178  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
551 aa  174  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  32.94 
 
 
853 aa  173  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
488 aa  172  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.38 
 
 
1255 aa  171  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
588 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
671 aa  169  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
408 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  38.58 
 
 
647 aa  167  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 
801 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  30.18 
 
 
852 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  36.36 
 
 
490 aa  165  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
852 aa  165  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
953 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 
575 aa  164  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  32.98 
 
 
1061 aa  163  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
695 aa  163  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  38.34 
 
 
313 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.1 
 
 
804 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
557 aa  161  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
525 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.68 
 
 
578 aa  161  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
844 aa  160  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  40.16 
 
 
1062 aa  160  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
630 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.03 
 
 
952 aa  160  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 
525 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
592 aa  159  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
544 aa  158  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2729  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
702 aa  159  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.346218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2028  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 
1247 aa  158  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.138072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  27.73 
 
 
556 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2844  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 
550 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
557 aa  158  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
557 aa  157  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  34.57 
 
 
592 aa  157  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2233  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 
552 aa  157  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0296242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
722 aa  157  9e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2824  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 
645 aa  156  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3371  histidine kinase  38.63 
 
 
887 aa  157  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1768  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
576 aa  157  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
701 aa  156  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.282736 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
587 aa  156  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.52 
 
 
819 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 
654 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1987  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
552 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 
607 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
510 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  38.14 
 
 
912 aa  154  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  41.18 
 
 
672 aa  154  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  35.91 
 
 
395 aa  154  5e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
682 aa  154  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
683 aa  154  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2392  histidine kinase  39.32 
 
 
502 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
394 aa  154  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  34.43 
 
 
394 aa  153  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
552 aa  153  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
520 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1356  histidine kinase  36.6 
 
 
591 aa  153  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.02 
 
 
541 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2189  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
726 aa  152  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1990  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 
677 aa  151  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.871736  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0638  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
373 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4196  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
680 aa  151  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0175164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
672 aa  151  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0701  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
545 aa  151  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.310619 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
760 aa  151  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
507 aa  151  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  38.15 
 
 
516 aa  151  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
523 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
523 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
631 aa  150  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
552 aa  150  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  33.58 
 
 
410 aa  150  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  34.55 
 
 
522 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
505 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141182 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2366  two component sensor histidine kinase  30.81 
 
 
1154 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0469089  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
855 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 
842 aa  150  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  30.31 
 
 
621 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  40.45 
 
 
673 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
702 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3002  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 
1234 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 
1168 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
540 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0813  histidine kinase  36.68 
 
 
587 aa  149  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
655 aa  149  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0073  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
505 aa  149  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.38 
 
 
598 aa  148  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.06 
 
 
679 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>