More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1057 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  76.84 
 
 		 674 aa  1044    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  100 
 
 		 673 aa  1358    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.13 
 
 		 661 aa  716    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.39 
 
 		 662 aa  865    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.57 
 
 		 671 aa  716    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.88 
 
 		 672 aa  731    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  55.47 
 
 		 661 aa  709    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  55.18 
 
 		 672 aa  729    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.59 
 
 		 691 aa  836    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  42.1 
 
 		 614 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  36.69 
 
 		 693 aa  348  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 690 aa  346  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 714 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 676 aa  320  7e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3736  histidine kinase  34.03 
 
 		 675 aa  317  6e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  37.76 
 
 		 676 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 709 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000275597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02266  hypothetical protein  33.87 
 
 		 680 aa  313  5.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3194  histidine kinase  37.89 
 
 		 663 aa  313  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3965  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 711 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4075  ATPase domain-containing protein  34.74 
 
 		 711 aa  311  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00205283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003502  signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 659 aa  310  5.9999999999999995e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0089  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 705 aa  309  9e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0206322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 717 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.243225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1828  sensor histidine kinase  33.03 
 
 		 674 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.719935  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 717 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273141  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4717  sensor histidine kinase  34.59 
 
 		 709 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4260  histidine kinase  34.98 
 
 		 717 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000203667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 717 aa  308  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00270553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4092  histidine kinase  35.44 
 
 		 706 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1128  sensor histidine kinase  33.92 
 
 		 677 aa  304  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  30.75 
 
 		 647 aa  302  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 707 aa  301  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000535893  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0126  sensor histidine kinase  34.52 
 
 		 708 aa  301  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000118135  normal  0.929624 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1403  signal transduction protein, histidine kinase  35.83 
 
 		 675 aa  296  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 705 aa  295  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 713 aa  293  8e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0360535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1168  sensor histidine kinase  32.39 
 
 		 685 aa  290  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.527437 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1695  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 691 aa  289  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 658 aa  280  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 639 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 640 aa  274  3e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 639 aa  269  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 639 aa  264  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 699 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 656 aa  254  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755968  normal  0.278919 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 641 aa  250  7e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 522 aa  233  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.81 
 
 		 541 aa  224  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  39.13 
 
 		 516 aa  220  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 542 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  39.54 
 
 		 542 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 570 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 655 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  37.77 
 
 		 560 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  36.94 
 
 		 655 aa  203  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 548 aa  203  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  35.71 
 
 		 548 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 		 488 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 544 aa  201  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 548 aa  200  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 656 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  33.62 
 
 		 656 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 584 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  38.05 
 
 		 667 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 586 aa  194  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 655 aa  193  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  35.95 
 
 		 584 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 		 475 aa  190  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  38.32 
 
 		 600 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 540 aa  188  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  37.26 
 
 		 592 aa  187  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.63 
 
 		 819 aa  184  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 614 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  43.8 
 
 		 912 aa  184  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 592 aa  184  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 515 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.88 
 
 		 804 aa  181  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 		 620 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  32.16 
 
 		 490 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 498 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 367 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  32.72 
 
 		 484 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4226  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 613 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156155  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 970 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  35.83 
 
 		 517 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 919 aa  179  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  33.44 
 
 		 500 aa  178  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  33.89 
 
 		 531 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 395 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 394 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.39 
 
 		 819 aa  177  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  37.7 
 
 		 611 aa  177  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1745  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.96 
 
 		 424 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 646 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 		 408 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 402 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>