More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1700 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 591 aa  1202    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0233  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  62.8 
 
 		 553 aa  674    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.36 
 
 		 498 aa  552  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 540 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4160  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.35 
 
 		 516 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  40.91 
 
 		 655 aa  177  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 655 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 		 801 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 514 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  31.25 
 
 		 621 aa  172  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.8 
 
 		 516 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.73 
 
 		 744 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  37.79 
 
 		 500 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.81 
 
 		 365 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 970 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  31.48 
 
 		 617 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.58 
 
 		 1255 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 804 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 738 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 		 510 aa  164  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0835  histidine kinase  31.75 
 
 		 418 aa  163  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.882013  normal  0.0872609 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  40.69 
 
 		 516 aa  163  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  36.86 
 
 		 614 aa  163  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.78 
 
 		 819 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 682 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  31.37 
 
 		 608 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  31.09 
 
 		 608 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.1 
 
 		 1215 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 926 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  31.09 
 
 		 608 aa  159  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.09 
 
 		 608 aa  159  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 862 aa  158  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  31.09 
 
 		 608 aa  159  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 595 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  31.09 
 
 		 608 aa  159  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 		 642 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 655 aa  158  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  35.8 
 
 		 517 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  29.72 
 
 		 1092 aa  158  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 656 aa  158  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  36.99 
 
 		 656 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  30.28 
 
 		 830 aa  156  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 552 aa  156  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0622  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 753 aa  156  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 475 aa  156  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  32.86 
 
 		 533 aa  156  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 819 aa  156  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  31.12 
 
 		 410 aa  156  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0311  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.52 
 
 		 383 aa  156  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.138677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  32.86 
 
 		 533 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0283  sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 600 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 408 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.397309  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3565  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 641 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.38 
 
 		 541 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 494 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1826  histidine kinase  34.24 
 
 		 418 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.778764  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 504 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113715  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.44 
 
 		 679 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  38.63 
 
 		 490 aa  154  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  30.12 
 
 		 936 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.9 
 
 		 598 aa  154  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  37.66 
 
 		 560 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1970  sensory box histidine kinase  28.33 
 
 		 415 aa  153  7e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.645732  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  36.64 
 
 		 484 aa  153  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 488 aa  153  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  30.62 
 
 		 611 aa  153  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 586 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  31.59 
 
 		 1061 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  31.34 
 
 		 363 aa  153  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  32.39 
 
 		 556 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 662 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 		 926 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.61 
 
 		 363 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 551 aa  151  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2148  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 729 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3122  sporulation kinase  36.02 
 
 		 801 aa  151  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 661 aa  151  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  36.33 
 
 		 313 aa  151  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  38.74 
 
 		 912 aa  150  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0331  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 441 aa  150  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301894 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2115  sporulation kinase  36.02 
 
 		 801 aa  150  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1990  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 677 aa  150  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.871736  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  32.94 
 
 		 531 aa  150  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.64 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  36.29 
 
 		 584 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 642 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2889  sensory transduction histidine kinase; sporulation kinase A  35.59 
 
 		 801 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.516791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3143  sporulation kinase  35.59 
 
 		 801 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.564779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0853  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 543 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0172043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 584 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  30.14 
 
 		 1062 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 491 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3364  histidine kinase  39.64 
 
 		 249 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  36.48 
 
 		 465 aa  148  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1880  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 612 aa  148  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 430 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 542 aa  148  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>