More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0853 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3252  sensor histidine kinase  60.77 
 
 		 547 aa  697    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3180  GAF sensor signal transduction histidine kinase  60.85 
 
 		 540 aa  698    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.178138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3467  GAF sensor signal transduction histidine kinase  68.02 
 
 		 540 aa  782    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0853  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 543 aa  1127    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0172043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0405  GAF sensor signal transduction histidine kinase  53.97 
 
 		 553 aa  615  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0030  GAF sensor signal transduction histidine kinase  54.11 
 
 		 533 aa  595  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0283  sensor histidine kinase  26.26 
 
 		 600 aa  187  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3279  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 608 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00154728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0128  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.31 
 
 		 780 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000607213  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2759  two component sensor histidine kinase  26.3 
 
 		 764 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000152723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 469 aa  158  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00245745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4097  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24 
 
 		 766 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0915  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.68 
 
 		 800 aa  152  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0420  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 458 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00956949  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 591 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4002  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.4 
 
 		 765 aa  144  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21320  diguanylate cyclase  31.84 
 
 		 510 aa  140  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0233  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 553 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 		 1519 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.13 
 
 		 1527 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 1527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0446  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 		 1527 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1992  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 655 aa  120  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  32.02 
 
 		 655 aa  118  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 655 aa  118  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.56 
 
 		 747 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 656 aa  118  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 		 689 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0334119  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.56 
 
 		 747 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  30.47 
 
 		 656 aa  117  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 551 aa  117  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 368 aa  117  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.92 
 
 		 747 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2307  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 506 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 422 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 480 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 867 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0515  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 689 aa  114  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.92 
 
 		 752 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 492 aa  114  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3327  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.26559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  28.24 
 
 		 673 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  28.9 
 
 		 234 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 903 aa  111  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 929 aa  111  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3869  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.39 
 
 		 611 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.793663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  28.9 
 
 		 674 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  25.38 
 
 		 830 aa  110  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 492 aa  110  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1470  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 755 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.797654  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3785  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.39 
 
 		 611 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.862005  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0941  sensor histidine kinase, putative  29.91 
 
 		 248 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 720 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.916012  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.72 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0696  histidine kinase  28.95 
 
 		 248 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0073771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 570 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3670  sporulation kinase A  28.57 
 
 		 510 aa  108  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.825905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3674  sporulation kinase A  28.57 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.123371  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 862 aa  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  29.71 
 
 		 853 aa  107  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  31.14 
 
 		 394 aa  107  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  23.53 
 
 		 1744 aa  106  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  29.02 
 
 		 584 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2293  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.72 
 
 		 782 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 548 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 987 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 540 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2307  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 551 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 577 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  32.33 
 
 		 1062 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  28.79 
 
 		 548 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 518 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  27.03 
 
 		 517 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.78 
 
 		 793 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 		 652 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3344  sporulation kinase A  27.78 
 
 		 510 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 494 aa  104  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0638  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 373 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3393  sporulation kinase A  28.94 
 
 		 510 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.785669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 396 aa  104  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.02 
 
 		 578 aa  104  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.43 
 
 		 581 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1567  sporulation kinase A  27.35 
 
 		 510 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.800828 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  26.98 
 
 		 912 aa  103  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  31.08 
 
 		 395 aa  103  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 548 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0096  histidine kinase  28.83 
 
 		 525 aa  103  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1365  histidine kinase  29.05 
 
 		 496 aa  103  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3749  sporulation kinase A  27.35 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  29.76 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 402 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 546 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00093231 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.33 
 
 		 556 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  28.99 
 
 		 614 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>