More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0420 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0420  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
458 aa  948    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00956949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4097  GAF sensor signal transduction histidine kinase  50.56 
 
 
766 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0128  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.66 
 
 
780 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000607213  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4002  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.78 
 
 
765 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.85 
 
 
469 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00245745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3279  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 
608 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00154728  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0283  sensor histidine kinase  42.76 
 
 
600 aa  364  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2759  two component sensor histidine kinase  40.4 
 
 
764 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000152723  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0915  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
800 aa  183  6e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
488 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
492 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3180  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
540 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.178138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
475 aa  160  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3467  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 
540 aa  156  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
395 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
396 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
396 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1119  sensor histidine kinase/response regulator  34.82 
 
 
420 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
691 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  36.44 
 
 
391 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0853  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 
543 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0172043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
394 aa  149  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
1168 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
661 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
903 aa  147  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
367 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
867 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  35.56 
 
 
661 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3252  sensor histidine kinase  25.65 
 
 
547 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
378 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
844 aa  144  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  35.27 
 
 
674 aa  142  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
1519 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
510 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0612  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0127194  normal  0.714429 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  36.69 
 
 
499 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
655 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0437  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.148474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
491 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0405  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 
553 aa  141  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  35.1 
 
 
655 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
673 aa  140  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  36.51 
 
 
367 aa  139  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0903  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
898 aa  139  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345455  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4160  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.09 
 
 
516 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
656 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  32.79 
 
 
465 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  33.99 
 
 
560 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
586 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  32.79 
 
 
465 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
540 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  35.1 
 
 
363 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  32.79 
 
 
465 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  33.2 
 
 
673 aa  139  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  33.47 
 
 
656 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  32.79 
 
 
465 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  33.2 
 
 
465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
494 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.72 
 
 
457 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.23 
 
 
490 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1470  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
755 aa  137  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.797654  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
720 aa  137  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.916012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0030  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 
533 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  34.44 
 
 
617 aa  136  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
515 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  33.46 
 
 
604 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  38.72 
 
 
502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  36.18 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
662 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  33.76 
 
 
592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  37.99 
 
 
501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  34.11 
 
 
419 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 
819 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
804 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
516 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.19 
 
 
598 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
653 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1365  histidine kinase  32.11 
 
 
496 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
592 aa  134  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
522 aa  134  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.07 
 
 
604 aa  133  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
1527 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  35.51 
 
 
412 aa  133  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.34 
 
 
752 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  37.27 
 
 
621 aa  133  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
559 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
584 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  33.86 
 
 
548 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  35.54 
 
 
573 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
516 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
548 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
586 aa  132  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.64 
 
 
747 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
1527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0446  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
1527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.64 
 
 
747 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.22 
 
 
516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.597722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>