More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0494 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  66.25 
 
 		 487 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  66.53 
 
 		 499 aa  678    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  77.91 
 
 		 517 aa  791    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  76.99 
 
 		 494 aa  770    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 491 aa  1011    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  34.83 
 
 		 502 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 502 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.42 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  33.47 
 
 		 501 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 522 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 		 390 aa  232  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  31.78 
 
 		 516 aa  230  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 542 aa  226  8e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.7 
 
 		 541 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 544 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 570 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  30.23 
 
 		 542 aa  210  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  30.99 
 
 		 560 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  29.36 
 
 		 584 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 584 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 586 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  42.98 
 
 		 367 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 656 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  37.42 
 
 		 656 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 476 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  29.53 
 
 		 468 aa  194  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 540 aa  193  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 655 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3818  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 468 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.634058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 691 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  28.43 
 
 		 484 aa  190  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 		 367 aa  189  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  39.06 
 
 		 655 aa  189  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 473 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  40.18 
 
 		 458 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  40.18 
 
 		 458 aa  187  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 480 aa  186  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  39.73 
 
 		 458 aa  186  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  39.73 
 
 		 458 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  39.29 
 
 		 458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 662 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  39.73 
 
 		 458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  31.62 
 
 		 531 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 488 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  39.29 
 
 		 465 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 548 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  41.23 
 
 		 367 aa  183  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 655 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 528 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.828791  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.3 
 
 		 747 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.3 
 
 		 747 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 515 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  39.29 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  40.25 
 
 		 614 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.22 
 
 		 598 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  33.64 
 
 		 674 aa  181  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 505 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141182 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  28.25 
 
 		 548 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.85 
 
 		 747 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  38.35 
 
 		 621 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 475 aa  177  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  31.18 
 
 		 490 aa  176  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 673 aa  176  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  27.16 
 
 		 500 aa  176  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 548 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.66 
 
 		 752 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  32.86 
 
 		 661 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  32.71 
 
 		 673 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 661 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.52 
 
 		 365 aa  173  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 595 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 575 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  42.04 
 
 		 611 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  32.5 
 
 		 522 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  37.55 
 
 		 363 aa  172  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 630 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  31.63 
 
 		 667 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 801 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 586 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 518 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 516 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0096  histidine kinase  27.36 
 
 		 525 aa  170  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 646 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2127  histidine kinase  25.6 
 
 		 483 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 654 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 516 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  37.45 
 
 		 611 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2161  two component sensor histidine kinase  31.52 
 
 		 481 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.37303e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 658 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  32.51 
 
 		 693 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  36.64 
 
 		 234 aa  167  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0604  histidine kinase  34.74 
 
 		 516 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 488 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  31.82 
 
 		 581 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 378 aa  166  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  33.79 
 
 		 550 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 372 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 671 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>