More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1365 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1365  histidine kinase  100 
 
 
496 aa  1021    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 
492 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1992  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 
372 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  33.78 
 
 
542 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.13 
 
 
541 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  32.62 
 
 
516 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
498 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
492 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
804 aa  156  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
542 aa  156  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
522 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.34 
 
 
598 aa  154  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
1519 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
525 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
525 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 
1131 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
738 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
548 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  34.3 
 
 
581 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
691 aa  150  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.07 
 
 
819 aa  150  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
581 aa  150  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 
819 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1650  histidine kinase  31.42 
 
 
612 aa  149  9e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  34.75 
 
 
595 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3818  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.634058  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
591 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
488 aa  148  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  35.43 
 
 
584 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.9 
 
 
581 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0233  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
553 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446176  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
491 aa  147  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  30.82 
 
 
468 aa  147  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
673 aa  147  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  32.37 
 
 
548 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
570 aa  146  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.61 
 
 
744 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
548 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
540 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  34.36 
 
 
595 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  34.36 
 
 
595 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
671 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  34.36 
 
 
595 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  32.7 
 
 
560 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  31.77 
 
 
502 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
502 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
662 aa  144  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.77 
 
 
457 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  29.07 
 
 
501 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
584 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
378 aa  143  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  33.98 
 
 
595 aa  143  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
476 aa  142  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
495 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  34.87 
 
 
509 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2161  two component sensor histidine kinase  27.33 
 
 
481 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.37303e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
526 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
586 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  32.09 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
559 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  34.87 
 
 
499 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.05 
 
 
546 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  32.36 
 
 
490 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
595 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0288015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  35.66 
 
 
1092 aa  141  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
367 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  35.83 
 
 
621 aa  141  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
488 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
494 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
543 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
592 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
498 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
518 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  33.08 
 
 
592 aa  140  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3269  sensor protein  31.12 
 
 
619 aa  140  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.19 
 
 
547 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  34.2 
 
 
234 aa  139  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1793  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
591 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.456575  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  33.21 
 
 
517 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3674  sporulation kinase A  33.33 
 
 
510 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.123371  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
544 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.71 
 
 
604 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  36.71 
 
 
604 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  33.62 
 
 
595 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3670  sporulation kinase A  33.33 
 
 
510 aa  139  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.825905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  32.82 
 
 
590 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  33.07 
 
 
499 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
1527 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1327  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
375 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.19 
 
 
490 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0128  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
780 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000607213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  31.75 
 
 
614 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  34.82 
 
 
611 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  33.19 
 
 
661 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1880  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
612 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2307  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
506 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.78 
 
 
491 aa  138  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3749  sporulation kinase A  33.19 
 
 
510 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>