More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3376 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  60.78 
 
 
674 aa  814    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.62 
 
 
661 aa  722    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  53.88 
 
 
672 aa  699    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  61.59 
 
 
673 aa  836    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.47 
 
 
672 aa  709    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.16 
 
 
671 aa  730    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
691 aa  1384    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.55 
 
 
662 aa  861    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  53.84 
 
 
661 aa  724    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  39.46 
 
 
614 aa  426  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  37.7 
 
 
693 aa  372  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
690 aa  348  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3736  histidine kinase  33.38 
 
 
675 aa  322  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1828  sensor histidine kinase  36.14 
 
 
674 aa  319  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.719935  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
714 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3194  histidine kinase  35.53 
 
 
663 aa  319  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
676 aa  319  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122155  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  34.94 
 
 
676 aa  318  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0126  sensor histidine kinase  35.63 
 
 
708 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000118135  normal  0.929624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3965  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
711 aa  308  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131359  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4075  ATPase domain-containing protein  35.08 
 
 
711 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00205283  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4260  histidine kinase  36.27 
 
 
717 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000203667  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
709 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000275597  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
717 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
717 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.243225  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0089  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
705 aa  303  9e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0206322  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4717  sensor histidine kinase  34.44 
 
 
709 aa  302  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
717 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00270553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4092  histidine kinase  35.61 
 
 
706 aa  302  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1695  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
691 aa  300  8e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113476  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02266  hypothetical protein  34.95 
 
 
680 aa  298  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
705 aa  297  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
707 aa  296  9e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000535893  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
713 aa  295  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0360535  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  30.35 
 
 
647 aa  294  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1403  signal transduction protein, histidine kinase  34.11 
 
 
675 aa  294  5e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003502  signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 
659 aa  292  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1168  sensor histidine kinase  34.13 
 
 
685 aa  291  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.527437 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1128  sensor histidine kinase  37.43 
 
 
677 aa  291  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
658 aa  290  8e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
699 aa  287  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 
640 aa  263  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
656 aa  260  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755968  normal  0.278919 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
639 aa  243  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 
639 aa  240  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 
639 aa  236  8e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
522 aa  236  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  34.7 
 
 
516 aa  228  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
641 aa  228  4e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.58 
 
 
541 aa  213  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  36.99 
 
 
560 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
542 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
544 aa  201  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  37.68 
 
 
667 aa  200  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
586 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
584 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  36.64 
 
 
542 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
510 aa  197  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
570 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  36.52 
 
 
584 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.64 
 
 
819 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
491 aa  191  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
548 aa  190  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
646 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
655 aa  189  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  35.22 
 
 
655 aa  187  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  34.24 
 
 
548 aa  187  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.15 
 
 
819 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4226  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
613 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156155  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
548 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  32.4 
 
 
517 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
488 aa  184  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
492 aa  184  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  32.81 
 
 
499 aa  184  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  36.23 
 
 
531 aa  183  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
494 aa  184  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 
614 aa  182  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  40.15 
 
 
367 aa  180  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4382  histidine kinase  35.99 
 
 
646 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540034  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
475 aa  179  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
528 aa  178  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.828791  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
656 aa  178  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  32.67 
 
 
656 aa  177  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  34.31 
 
 
592 aa  177  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.08 
 
 
804 aa  177  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
655 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
592 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  36.21 
 
 
600 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3096  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
659 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
498 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
395 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
488 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
970 aa  173  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
367 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  31.91 
 
 
490 aa  171  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
390 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
557 aa  171  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
566 aa  170  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 
801 aa  169  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2127  histidine kinase  32.23 
 
 
483 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>