More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0531 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  100 
 
 
611 aa  1227    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  44.97 
 
 
621 aa  501  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  40.41 
 
 
611 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0969  sensory histidine kinase AtoS  39.55 
 
 
622 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000351141  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  34.4 
 
 
614 aa  360  5e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  31.28 
 
 
608 aa  258  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  31.89 
 
 
613 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167481 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  31.12 
 
 
608 aa  257  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  31.12 
 
 
608 aa  257  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.12 
 
 
608 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  30.96 
 
 
608 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  31.12 
 
 
608 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  30.72 
 
 
617 aa  253  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.05 
 
 
598 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.57 
 
 
679 aa  204  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2148  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
729 aa  193  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.94 
 
 
819 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
586 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.26 
 
 
631 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1970  sensory box histidine kinase  32.03 
 
 
415 aa  182  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.645732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
540 aa  180  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.65 
 
 
578 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
592 aa  179  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  42.08 
 
 
542 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  36.42 
 
 
830 aa  176  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.71 
 
 
679 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
522 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  44.74 
 
 
450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
738 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.9 
 
 
538 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.97 
 
 
539 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.87 
 
 
581 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.93 
 
 
819 aa  173  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.23 
 
 
547 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 
491 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.18 
 
 
744 aa  173  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
970 aa  171  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.83 
 
 
546 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  40.53 
 
 
458 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
582 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0292  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
393 aa  169  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.183452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  40.34 
 
 
673 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3078  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.73 
 
 
369 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  35.57 
 
 
550 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.33 
 
 
541 aa  169  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 
804 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  41.1 
 
 
234 aa  168  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  40.09 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
801 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  40.09 
 
 
458 aa  167  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  40.09 
 
 
458 aa  167  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1745  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.73 
 
 
424 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
689 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  40.09 
 
 
465 aa  167  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  33.23 
 
 
604 aa  166  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 
759 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0119  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
571 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.412791  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0311  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.35 
 
 
383 aa  166  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.138677  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 
542 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.23 
 
 
604 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  37.76 
 
 
516 aa  165  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4160  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.47 
 
 
516 aa  165  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  42.11 
 
 
517 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 
576 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
673 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.18 
 
 
491 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  31.08 
 
 
509 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
595 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0288015  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
595 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 
494 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
1222 aa  164  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  31.08 
 
 
499 aa  163  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
567 aa  164  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  31.08 
 
 
595 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  31.08 
 
 
595 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  39.65 
 
 
458 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  33.13 
 
 
595 aa  163  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
1432 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  31.08 
 
 
595 aa  163  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  30.56 
 
 
595 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
394 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
680 aa  162  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
492 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2307  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
506 aa  162  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
492 aa  161  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
855 aa  161  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 
396 aa  160  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  39.65 
 
 
458 aa  160  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
662 aa  160  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  39.75 
 
 
674 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  32.31 
 
 
595 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 
627 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
1428 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 
1519 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
832 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 
1677 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.785659  normal  0.992917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 
857 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2848  histidine kinase  38.7 
 
 
481 aa  159  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
525 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
526 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>