More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1634 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  87.36 
 
 		 539 aa  952    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 		 538 aa  1089    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2679  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.43 
 
 		 544 aa  586  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  52.04 
 
 		 547 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  51.75 
 
 		 550 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.57 
 
 		 549 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.79 
 
 		 543 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 559 aa  340  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0119  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 571 aa  286  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.412791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 525 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 525 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.03 
 
 		 546 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 582 aa  257  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 526 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1389  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.71 
 
 		 550 aa  253  8.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.531963  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  33.24 
 
 		 613 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.98 
 
 		 598 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 		 802 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 		 679 aa  177  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  34.9 
 
 		 611 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  32.28 
 
 		 617 aa  174  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.87 
 
 		 578 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 970 aa  173  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 722 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100019 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0184  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.44 
 
 		 555 aa  170  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  29.6 
 
 		 621 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2698  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 438 aa  169  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3120  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.15 
 
 		 561 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.97 
 
 		 604 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3869  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.01 
 
 		 611 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.793663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1745  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.53 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.14 
 
 		 1215 aa  164  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 367 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.3 
 
 		 679 aa  164  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  33.24 
 
 		 975 aa  164  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1658  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.15 
 
 		 579 aa  164  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0362267  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3785  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.01 
 
 		 611 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.862005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.57 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 564 aa  162  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 595 aa  162  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  35.86 
 
 		 590 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  29.74 
 
 		 604 aa  161  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1175  hypothetical protein  28.28 
 
 		 528 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 		 953 aa  160  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1181  hypothetical protein  28.01 
 
 		 528 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  35.86 
 
 		 595 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  35.44 
 
 		 595 aa  160  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2848  histidine kinase  36.17 
 
 		 481 aa  160  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  35.86 
 
 		 595 aa  159  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  35.86 
 
 		 595 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  35.86 
 
 		 595 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  28.57 
 
 		 614 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  36.58 
 
 		 853 aa  158  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  35.86 
 
 		 595 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.83 
 
 		 929 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 671 aa  158  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3078  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.34 
 
 		 369 aa  158  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  35.86 
 
 		 509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.15 
 
 		 491 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  35.86 
 
 		 499 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  31.01 
 
 		 363 aa  156  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.39 
 
 		 581 aa  156  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  39.91 
 
 		 458 aa  156  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 673 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  39.47 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  28.6 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  38.5 
 
 		 367 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 595 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0288015  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.6 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 372 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  30.09 
 
 		 608 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.09 
 
 		 608 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  30.09 
 
 		 608 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  30.09 
 
 		 608 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 592 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  30.09 
 
 		 608 aa  154  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  38.7 
 
 		 367 aa  154  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1306  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 		 763 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147703  normal  0.027228 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  39.04 
 
 		 458 aa  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 581 aa  153  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0799101  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1880  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 612 aa  153  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  39.04 
 
 		 458 aa  153  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 498 aa  153  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 372 aa  153  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  30.09 
 
 		 608 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  39.04 
 
 		 465 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  38.6 
 
 		 458 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  38.6 
 
 		 458 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.35 
 
 		 819 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  35.02 
 
 		 852 aa  152  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 852 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.8 
 
 		 362 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  38.67 
 
 		 412 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 689 aa  150  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  38.6 
 
 		 458 aa  150  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 586 aa  150  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  36.61 
 
 		 581 aa  150  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.58 
 
 		 747 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.58 
 
 		 747 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1893  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 985 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.426931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>