More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2454 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  100 
 
 		 367 aa  725    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  77.38 
 
 		 367 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70.99 
 
 		 367 aa  510  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.78 
 
 		 372 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  60.85 
 
 		 369 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.56 
 
 		 364 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.49 
 
 		 372 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.17 
 
 		 378 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 491 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  40.62 
 
 		 517 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 		 691 aa  189  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 494 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  42.86 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  42.42 
 
 		 458 aa  186  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.13 
 
 		 547 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 		 586 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  41.99 
 
 		 458 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  43.1 
 
 		 550 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0096  histidine kinase  41.56 
 
 		 525 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  41.56 
 
 		 465 aa  182  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  41.99 
 
 		 458 aa  182  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  42.42 
 
 		 458 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.99 
 
 		 598 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  41.15 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  41.15 
 
 		 465 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  41.15 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  41.99 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  41.15 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  41.15 
 
 		 465 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 662 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.96 
 
 		 578 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.13 
 
 		 604 aa  179  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  41.56 
 
 		 458 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  40.36 
 
 		 234 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  43.35 
 
 		 450 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.19 
 
 		 491 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  38.91 
 
 		 499 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  40.69 
 
 		 604 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.92 
 
 		 752 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.53 
 
 		 747 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.53 
 
 		 747 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.78 
 
 		 679 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  37.2 
 
 		 673 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 671 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 		 1519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.68 
 
 		 747 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  42.19 
 
 		 363 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  36.52 
 
 		 674 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  38.81 
 
 		 661 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  41.74 
 
 		 487 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 475 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 510 aa  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 661 aa  170  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 526 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 525 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 673 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 525 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.93 
 
 		 362 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.42 
 
 		 546 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 		 672 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 680 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 		 592 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 575 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2148  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 729 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  40 
 
 		 608 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40 
 
 		 608 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  40 
 
 		 608 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  40 
 
 		 608 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  40 
 
 		 608 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 		 655 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  40.26 
 
 		 655 aa  166  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1327  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 		 375 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  40.97 
 
 		 617 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.56 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  40 
 
 		 608 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0824  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.6 
 
 		 616 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 631 aa  162  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  37.6 
 
 		 672 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2532  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2806  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.62 
 
 		 361 aa  162  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  43.42 
 
 		 419 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2628  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1404  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.62 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 656 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1993  two component sensor histidine kinase  38.82 
 
 		 366 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 		 492 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  35.27 
 
 		 531 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 738 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 543 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5559  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.18 
 
 		 752 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  37.31 
 
 		 656 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 548 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 582 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.67 
 
 		 539 aa  159  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 595 aa  159  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 855 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1745  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.49 
 
 		 424 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.52 
 
 		 581 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.87 
 
 		 490 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>