More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3390 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.16 
 
 		 691 aa  752    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  56.79 
 
 		 674 aa  743    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.6 
 
 		 661 aa  662    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.62 
 
 		 662 aa  748    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  55.57 
 
 		 673 aa  736    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  61.31 
 
 		 672 aa  796    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  52.19 
 
 		 661 aa  675    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.77 
 
 		 672 aa  803    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 671 aa  1356    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  41.04 
 
 		 614 aa  425  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 690 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  37.21 
 
 		 693 aa  351  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1828  sensor histidine kinase  35.4 
 
 		 674 aa  311  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.719935  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 		 676 aa  306  6e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  35.13 
 
 		 676 aa  306  6e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0126  sensor histidine kinase  36.73 
 
 		 708 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000118135  normal  0.929624 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3194  histidine kinase  33.84 
 
 		 663 aa  300  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 713 aa  296  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0360535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3965  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 711 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0089  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 705 aa  293  8e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0206322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003502  signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 659 aa  292  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4075  ATPase domain-containing protein  32.04 
 
 		 711 aa  292  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00205283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02266  hypothetical protein  36.4 
 
 		 680 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 658 aa  291  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 709 aa  290  6e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000275597  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4717  sensor histidine kinase  34.44 
 
 		 709 aa  290  8e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 705 aa  288  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 717 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00270553  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 717 aa  287  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.243225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 717 aa  287  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4260  histidine kinase  32.99 
 
 		 717 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000203667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1128  sensor histidine kinase  37.9 
 
 		 677 aa  286  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3736  histidine kinase  32.2 
 
 		 675 aa  286  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 699 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1695  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 691 aa  284  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 714 aa  283  9e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4092  histidine kinase  35.44 
 
 		 706 aa  282  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1403  signal transduction protein, histidine kinase  36.69 
 
 		 675 aa  282  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1168  sensor histidine kinase  32.77 
 
 		 685 aa  283  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.527437 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 707 aa  281  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000535893  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  32.2 
 
 		 647 aa  271  4e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 656 aa  270  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755968  normal  0.278919 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 640 aa  263  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 		 639 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 639 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 639 aa  243  9e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 641 aa  228  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 522 aa  225  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 544 aa  225  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  37.69 
 
 		 516 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 542 aa  223  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  42.77 
 
 		 542 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.14 
 
 		 541 aa  213  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  36.62 
 
 		 592 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  33.41 
 
 		 548 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 548 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 548 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 584 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 592 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 586 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  37.42 
 
 		 560 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 655 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  37.43 
 
 		 584 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 620 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 570 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 656 aa  182  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.63 
 
 		 614 aa  182  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 646 aa  181  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  35.95 
 
 		 656 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  37.86 
 
 		 655 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0283  sensor histidine kinase  41.6 
 
 		 600 aa  180  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  36.77 
 
 		 667 aa  180  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 655 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 497 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 510 aa  177  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0114  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 498 aa  177  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 819 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0125  histidine kinase  34.85 
 
 		 498 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 540 aa  174  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  39.74 
 
 		 367 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4226  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 613 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156155  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4382  histidine kinase  37.06 
 
 		 646 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540034  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.55 
 
 		 804 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 488 aa  170  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  32.61 
 
 		 490 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 970 aa  170  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  43.59 
 
 		 367 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0128  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 780 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000607213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 367 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 515 aa  168  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3269  sensor protein  34.22 
 
 		 619 aa  167  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.22 
 
 		 819 aa  166  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  41.49 
 
 		 912 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 497 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 491 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 		 613 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 395 aa  165  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 711 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.598881  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 475 aa  163  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2824  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 645 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>