More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1403 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02266  hypothetical protein  57.77 
 
 		 680 aa  761    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003502  signal transduction histidine kinase  57.19 
 
 		 659 aa  744    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1128  sensor histidine kinase  58.7 
 
 		 677 aa  751    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1403  signal transduction protein, histidine kinase  100 
 
 		 675 aa  1379    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4717  sensor histidine kinase  45.06 
 
 		 709 aa  571  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 		 709 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000275597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3965  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 711 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.51 
 
 		 714 aa  565  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4075  ATPase domain-containing protein  44.33 
 
 		 711 aa  567  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00205283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0126  sensor histidine kinase  45.28 
 
 		 708 aa  565  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000118135  normal  0.929624 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.99 
 
 		 707 aa  549  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000535893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4092  histidine kinase  44.19 
 
 		 706 aa  546  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.43 
 
 		 717 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00270553  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4260  histidine kinase  44.57 
 
 		 717 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000203667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.57 
 
 		 717 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.57 
 
 		 717 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.243225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0089  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 		 705 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0206322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 		 713 aa  527  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0360535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 705 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 699 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1695  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 691 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1828  sensor histidine kinase  34.09 
 
 		 674 aa  351  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.719935  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  34.03 
 
 		 693 aa  348  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 690 aa  330  7e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3194  histidine kinase  32.94 
 
 		 663 aa  324  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1168  sensor histidine kinase  35.12 
 
 		 685 aa  323  7e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.527437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3736  histidine kinase  33.43 
 
 		 675 aa  319  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 676 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  35.75 
 
 		 676 aa  312  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 658 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  35.83 
 
 		 673 aa  296  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 691 aa  294  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  36.59 
 
 		 674 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  36.99 
 
 		 661 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 661 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 662 aa  287  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 		 656 aa  275  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755968  normal  0.278919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 671 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 672 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  35.52 
 
 		 672 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  29.79 
 
 		 647 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 639 aa  178  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.43 
 
 		 541 aa  177  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 640 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 639 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 639 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  34.86 
 
 		 516 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 		 522 aa  169  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 641 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 548 aa  163  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 919 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  30.83 
 
 		 548 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  37.55 
 
 		 614 aa  162  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 		 588 aa  161  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 548 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  33.43 
 
 		 490 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  31.77 
 
 		 600 aa  153  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  37.34 
 
 		 608 aa  153  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  36.93 
 
 		 608 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.93 
 
 		 608 aa  152  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  36.93 
 
 		 608 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  36.93 
 
 		 608 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  35.86 
 
 		 542 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  36.93 
 
 		 608 aa  152  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 488 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.59 
 
 		 598 aa  152  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 542 aa  151  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  38.65 
 
 		 313 aa  151  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  35.55 
 
 		 567 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 570 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 367 aa  146  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 557 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 467 aa  145  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 557 aa  144  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 544 aa  144  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  34.31 
 
 		 560 aa  144  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 528 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.828791  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0273  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 917 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0039  histidine kinase  36.6 
 
 		 655 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  33.89 
 
 		 584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  33.44 
 
 		 358 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  29.59 
 
 		 626 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 586 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 699 aa  141  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 656 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 713 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  36.89 
 
 		 465 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  36.89 
 
 		 465 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  29.43 
 
 		 656 aa  140  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3608  sensor histidine kinase  33.78 
 
 		 313 aa  140  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4226  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 613 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156155  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  32.35 
 
 		 730 aa  140  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  36.89 
 
 		 465 aa  140  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0941  sensor histidine kinase, putative  37 
 
 		 248 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  36.89 
 
 		 465 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  36.89 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1745  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.89 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2807  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 505 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>