More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0888 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  100 
 
 		 647 aa  1328    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  30.75 
 
 		 673 aa  302  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 691 aa  294  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  30.52 
 
 		 674 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 662 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 671 aa  270  8.999999999999999e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 661 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  29.91 
 
 		 661 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  29.38 
 
 		 672 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 672 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  28.89 
 
 		 614 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003502  signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 659 aa  221  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 544 aa  219  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 		 522 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 		 690 aa  217  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 676 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02266  hypothetical protein  30.25 
 
 		 680 aa  212  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 709 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000275597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3965  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 711 aa  211  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4075  ATPase domain-containing protein  31.08 
 
 		 711 aa  210  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00205283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 542 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4092  histidine kinase  29.32 
 
 		 706 aa  209  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  36.25 
 
 		 516 aa  208  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0126  sensor histidine kinase  29.4 
 
 		 708 aa  206  9e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000118135  normal  0.929624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.94 
 
 		 541 aa  206  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 658 aa  206  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4717  sensor histidine kinase  30.59 
 
 		 709 aa  205  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  30.8 
 
 		 676 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  30.57 
 
 		 693 aa  204  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1128  sensor histidine kinase  31.63 
 
 		 677 aa  204  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1828  sensor histidine kinase  28.9 
 
 		 674 aa  203  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.719935  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1403  signal transduction protein, histidine kinase  29.79 
 
 		 675 aa  202  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 713 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0360535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  38.31 
 
 		 542 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 717 aa  200  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.243225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 717 aa  200  7e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4260  histidine kinase  30.27 
 
 		 717 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000203667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  33.33 
 
 		 531 aa  200  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 707 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000535893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 717 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00270553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.57 
 
 		 819 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1695  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 691 aa  197  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 630 aa  197  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 654 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 		 801 aa  196  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 656 aa  196  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755968  normal  0.278919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 705 aa  195  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3194  histidine kinase  31.55 
 
 		 663 aa  195  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 639 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 		 588 aa  194  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  41.43 
 
 		 1092 aa  194  5e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0089  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 705 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0206322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 488 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1168  sensor histidine kinase  29.83 
 
 		 685 aa  191  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.527437 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  37.5 
 
 		 490 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.22 
 
 		 819 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 498 aa  187  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2127  histidine kinase  32.93 
 
 		 483 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 699 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2042  sensor histidine kinase  36.2 
 
 		 524 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  36.24 
 
 		 592 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 528 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.828791  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 592 aa  182  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 640 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  34.28 
 
 		 560 aa  180  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 639 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 		 714 aa  179  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 639 aa  177  8e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  38.87 
 
 		 410 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 584 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 620 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.32 
 
 		 1255 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 540 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  42.69 
 
 		 1258 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  32.91 
 
 		 584 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 586 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  28.52 
 
 		 581 aa  174  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  40.55 
 
 		 358 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  35.67 
 
 		 313 aa  173  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 505 aa  173  9e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141182 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0039  histidine kinase  38.31 
 
 		 655 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 567 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 557 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1744  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 376 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000105238  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 		 804 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 510 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 557 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 641 aa  171  5e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 		 844 aa  171  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3736  histidine kinase  27.51 
 
 		 675 aa  170  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 		 1262 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  38.78 
 
 		 1112 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2807  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 505 aa  170  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 495 aa  169  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.85 
 
 		 853 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  40.07 
 
 		 358 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  40.07 
 
 		 358 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 570 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  40.07 
 
 		 389 aa  168  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>