More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3194 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  82.5 
 
 		 676 aa  1025    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3194  histidine kinase  100 
 
 		 663 aa  1311    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  83.31 
 
 		 676 aa  1041    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.26 
 
 		 690 aa  725    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.04 
 
 		 658 aa  579  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1828  sensor histidine kinase  47.51 
 
 		 674 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.719935  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  50.83 
 
 		 693 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.55 
 
 		 656 aa  541  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755968  normal  0.278919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3736  histidine kinase  45.87 
 
 		 675 aa  501  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1168  sensor histidine kinase  45.81 
 
 		 685 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.527437 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1695  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 691 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 714 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0126  sensor histidine kinase  38.87 
 
 		 708 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000118135  normal  0.929624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4717  sensor histidine kinase  37.56 
 
 		 709 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4092  histidine kinase  37.4 
 
 		 706 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 709 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000275597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3965  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 711 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4075  ATPase domain-containing protein  37.46 
 
 		 711 aa  392  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00205283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0089  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 705 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0206322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 705 aa  389  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4260  histidine kinase  36.87 
 
 		 717 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000203667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 717 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.243225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 		 717 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00270553  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 713 aa  382  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0360535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.85 
 
 		 707 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000535893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 717 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273141  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 699 aa  362  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02266  hypothetical protein  33.33 
 
 		 680 aa  342  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1128  sensor histidine kinase  34.41 
 
 		 677 aa  340  4e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003502  signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 659 aa  332  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1403  signal transduction protein, histidine kinase  37.57 
 
 		 675 aa  331  3e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 691 aa  323  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  39.38 
 
 		 673 aa  319  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 662 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  35.44 
 
 		 674 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  34.12 
 
 		 672 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 672 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 671 aa  302  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 661 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  34.12 
 
 		 661 aa  293  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  35.27 
 
 		 614 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 641 aa  211  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 639 aa  211  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 639 aa  210  7e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 639 aa  205  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  31.55 
 
 		 647 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  33.97 
 
 		 516 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  36.41 
 
 		 667 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  38.28 
 
 		 542 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 640 aa  180  9e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.19 
 
 		 541 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 646 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 542 aa  171  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4226  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 613 aa  170  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 522 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4382  histidine kinase  37.58 
 
 		 646 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540034  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 494 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  32.53 
 
 		 517 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 570 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  42.24 
 
 		 389 aa  163  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  42.24 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 544 aa  163  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  42.24 
 
 		 389 aa  163  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  42.24 
 
 		 389 aa  163  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  42.24 
 
 		 389 aa  163  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  42.24 
 
 		 358 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 389 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  39.86 
 
 		 358 aa  160  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 588 aa  160  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  29.95 
 
 		 581 aa  160  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 919 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 491 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 592 aa  158  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 594 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 602 aa  157  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  35.13 
 
 		 592 aa  156  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 586 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 604 aa  156  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529725 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  36.34 
 
 		 626 aa  156  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  35.26 
 
 		 531 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  37.1 
 
 		 560 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  35.84 
 
 		 627 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2042  sensor histidine kinase  34.2 
 
 		 524 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  35.84 
 
 		 627 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  35.84 
 
 		 627 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  35.84 
 
 		 627 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  35.84 
 
 		 627 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  35.84 
 
 		 627 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  35.84 
 
 		 627 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 498 aa  154  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 699 aa  154  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 		 620 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2491  histidine kinase  37.69 
 
 		 626 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653758 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  34.94 
 
 		 600 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  35.56 
 
 		 524 aa  151  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 589 aa  152  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  31.08 
 
 		 499 aa  151  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2085  ATP-binding region ATPase domain protein  34.38 
 
 		 510 aa  151  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.158999  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  36.51 
 
 		 505 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>