More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2312 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  99.49 
 
 
389 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  99.16 
 
 
358 aa  728    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  99.23 
 
 
389 aa  788    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  99.44 
 
 
358 aa  730    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  99.23 
 
 
389 aa  788    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
389 aa  793    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  94.41 
 
 
358 aa  694    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  99.23 
 
 
389 aa  788    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  63.64 
 
 
626 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  63.53 
 
 
611 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  62.43 
 
 
611 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  63.53 
 
 
611 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  62.12 
 
 
627 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  62.12 
 
 
627 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  62.12 
 
 
627 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60.73 
 
 
589 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  62.12 
 
 
627 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  62.12 
 
 
627 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  62.12 
 
 
627 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  62.12 
 
 
627 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  58.84 
 
 
594 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.22 
 
 
602 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  57.19 
 
 
1187 aa  328  7e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  52.76 
 
 
681 aa  305  9.000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  53.98 
 
 
305 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  54.74 
 
 
467 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  51.41 
 
 
445 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  51.32 
 
 
467 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.55 
 
 
1465 aa  296  6e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  51.32 
 
 
505 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.34 
 
 
553 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  51.01 
 
 
408 aa  293  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  51.01 
 
 
408 aa  293  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  50 
 
 
470 aa  292  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.23 
 
 
1021 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  50.84 
 
 
406 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.32 
 
 
1146 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  53.56 
 
 
524 aa  280  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.04 
 
 
392 aa  280  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  47.97 
 
 
439 aa  280  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53 
 
 
683 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 
679 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 
683 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.55 
 
 
713 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2545  sensor histidine kinase  46.67 
 
 
429 aa  263  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 
678 aa  262  8e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0788  sensor histidine kinase  50 
 
 
465 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105833  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1200  sensor histidine kinase  50 
 
 
471 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0677  sensor histidine kinase  50 
 
 
538 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.755053  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1588  sensor histidine kinase  49.84 
 
 
502 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153224  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2403  sensor histidine kinase  49.7 
 
 
601 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1123  sensor histidine kinase  49.7 
 
 
471 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  47.86 
 
 
310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  42.31 
 
 
708 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3608  sensor histidine kinase  45.42 
 
 
313 aa  239  9e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3259  sensor histidine kinase  45.21 
 
 
598 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  36.81 
 
 
730 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  37.11 
 
 
724 aa  229  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
699 aa  229  8e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 
971 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  36.83 
 
 
433 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
566 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 
594 aa  225  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
688 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0658  sensor histide kinase  41.46 
 
 
315 aa  223  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  44.21 
 
 
1795 aa  223  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3474  histidine kinase  38.89 
 
 
449 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26810  putative two-component sensor  36.83 
 
 
371 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
715 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  37.21 
 
 
1808 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 
557 aa  216  8e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  42.35 
 
 
1797 aa  216  8e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  40.88 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  39.68 
 
 
1901 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  37.79 
 
 
1850 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  35.25 
 
 
726 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
585 aa  213  4.9999999999999996e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 
1123 aa  212  7.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  35.03 
 
 
715 aa  210  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
494 aa  209  8e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  38.56 
 
 
1780 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  37.58 
 
 
308 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 
431 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
680 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 
675 aa  206  5e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01455  sensor histidine kinase  40.65 
 
 
436 aa  206  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
537 aa  206  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  42.43 
 
 
920 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  38.76 
 
 
457 aa  206  6e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  42.61 
 
 
1794 aa  206  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  40.64 
 
 
458 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
439 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 
407 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2152  histidine kinase  36.83 
 
 
342 aa  203  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  35.26 
 
 
468 aa  203  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
641 aa  203  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
437 aa  203  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0024  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
390 aa  202  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.114696  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>