More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2467 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  100 
 
 		 627 aa  1261    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  100 
 
 		 627 aa  1261    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.57 
 
 		 602 aa  756    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  100 
 
 		 627 aa  1261    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  100 
 
 		 627 aa  1261    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  69.48 
 
 		 611 aa  755    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  68.02 
 
 		 589 aa  752    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  70.26 
 
 		 611 aa  781    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  91.23 
 
 		 626 aa  1102    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  99.52 
 
 		 627 aa  1255    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  69.57 
 
 		 594 aa  759    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  100 
 
 		 627 aa  1261    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  70.26 
 
 		 611 aa  781    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  100 
 
 		 627 aa  1261    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  61.82 
 
 		 358 aa  415  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  62.12 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  62.12 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  62.12 
 
 		 358 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  62.12 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  62.12 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  62.12 
 
 		 389 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  62.12 
 
 		 358 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  56.03 
 
 		 1187 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.13 
 
 		 553 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  53.55 
 
 		 305 aa  294  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  55.39 
 
 		 681 aa  292  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  49.55 
 
 		 467 aa  290  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.55 
 
 		 467 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.13 
 
 		 1021 aa  282  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  47.85 
 
 		 505 aa  280  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4735  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  62.65 
 
 		 689 aa  279  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0595206  normal  0.234911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.23 
 
 		 1465 aa  279  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  59.35 
 
 		 689 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  52.94 
 
 		 524 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2102  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  49.84 
 
 		 689 aa  273  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.762889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.03 
 
 		 392 aa  272  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0664  EAL/GGDEF domain-containing protein  62.2 
 
 		 688 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0241577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1106  diguanylate cyclase/cyclic diguanylate phosphodiesterase  62.2 
 
 		 688 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.804569  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1766  EAL/GGDEF domain-containing protein  62.2 
 
 		 688 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.356944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2392  EAL/GGDEF domain-containing protein  62.2 
 
 		 688 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278752  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0802  EAL/GGDEF domain-containing protein  62.2 
 
 		 688 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  50.49 
 
 		 406 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.13 
 
 		 1146 aa  270  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  48.81 
 
 		 408 aa  271  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  48.81 
 
 		 408 aa  271  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1182  GGDEF domain/EAL domain-containing protein  61.79 
 
 		 688 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.81 
 
 		 713 aa  270  7e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  47.91 
 
 		 470 aa  267  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  45.51 
 
 		 445 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  44.88 
 
 		 439 aa  263  6e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 679 aa  262  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  48.19 
 
 		 310 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1200  sensor histidine kinase  52.27 
 
 		 471 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0788  sensor histidine kinase  52.27 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105833  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.36 
 
 		 683 aa  258  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0677  sensor histidine kinase  52.27 
 
 		 538 aa  258  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.755053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1123  sensor histidine kinase  51.95 
 
 		 471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2403  sensor histidine kinase  51.95 
 
 		 601 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1588  sensor histidine kinase  47.71 
 
 		 502 aa  252  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153224  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 		 678 aa  250  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.51 
 
 		 683 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 		 766 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 594 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 699 aa  234  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2545  sensor histidine kinase  43.1 
 
 		 429 aa  233  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 566 aa  229  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4460  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  50.18 
 
 		 709 aa  229  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0200253  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 715 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  37.5 
 
 		 730 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3579  hypothetical protein  52.31 
 
 		 685 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0227937  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3259  sensor histidine kinase  41.01 
 
 		 598 aa  223  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408532  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49140  GGDEF domain protein  47.16 
 
 		 689 aa  223  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 440 aa  223  8e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 557 aa  223  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0401  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with MHYT sensor  53.97 
 
 		 687 aa  223  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.465852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  39.68 
 
 		 708 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 632 aa  220  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42220  membrane sensor domain-containing protein  51.92 
 
 		 685 aa  220  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  40.13 
 
 		 308 aa  219  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  42.61 
 
 		 1797 aa  219  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3608  sensor histidine kinase  41.7 
 
 		 313 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2525  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  52.3 
 
 		 693 aa  218  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3474  histidine kinase  37.46 
 
 		 449 aa  217  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0658  sensor histide kinase  40.19 
 
 		 315 aa  217  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3581  GGDEF domain-containing protein  51.94 
 
 		 695 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 585 aa  216  8e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2190  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  51.55 
 
 		 695 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  40.52 
 
 		 468 aa  216  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2427  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  49.81 
 
 		 683 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  35.33 
 
 		 1808 aa  213  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  35.69 
 
 		 726 aa  213  7.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0510  hypothetical protein  53.85 
 
 		 701 aa  213  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0522945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 688 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 494 aa  211  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 971 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  33.89 
 
 		 1850 aa  209  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 632 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0386  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  52.1 
 
 		 685 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2333  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  51.55 
 
 		 695 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>