More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3681 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0126  sensor histidine kinase  79.86 
 
 		 708 aa  1120    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000118135  normal  0.929624 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4260  histidine kinase  79.66 
 
 		 717 aa  1089    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000203667  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4717  sensor histidine kinase  80.65 
 
 		 709 aa  1126    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  79.52 
 
 		 717 aa  1088    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00270553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4092  histidine kinase  81.3 
 
 		 706 aa  1149    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 713 aa  1437    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0360535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  80.8 
 
 		 709 aa  1130    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000275597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3965  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  80.37 
 
 		 711 aa  1130    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  70.98 
 
 		 714 aa  1014    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0089  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  82.98 
 
 		 705 aa  1138    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0206322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  84.64 
 
 		 705 aa  1164    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  79.66 
 
 		 717 aa  1089    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.243225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  79.66 
 
 		 717 aa  1088    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273141  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4075  ATPase domain-containing protein  80.51 
 
 		 711 aa  1131    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00205283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.3 
 
 		 707 aa  1068    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000535893  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02266  hypothetical protein  45.59 
 
 		 680 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003502  signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 		 659 aa  570  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1128  sensor histidine kinase  46.03 
 
 		 677 aa  562  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1403  signal transduction protein, histidine kinase  43.87 
 
 		 675 aa  558  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 		 699 aa  493  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 690 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1695  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 691 aa  434  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  37.39 
 
 		 693 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1828  sensor histidine kinase  36.02 
 
 		 674 aa  395  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.719935  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3194  histidine kinase  37.02 
 
 		 663 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 676 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  36.22 
 
 		 676 aa  372  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1168  sensor histidine kinase  34.74 
 
 		 685 aa  365  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.527437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3736  histidine kinase  33.48 
 
 		 675 aa  358  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 658 aa  350  4e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 656 aa  344  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755968  normal  0.278919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 691 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 662 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  33.81 
 
 		 672 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 		 672 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  32.45 
 
 		 673 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 671 aa  302  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  32.94 
 
 		 674 aa  297  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 661 aa  296  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  32.08 
 
 		 661 aa  293  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  32.64 
 
 		 614 aa  226  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  28.76 
 
 		 647 aa  206  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  39.47 
 
 		 516 aa  185  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  38.49 
 
 		 542 aa  184  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 639 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 640 aa  177  8e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 639 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.14 
 
 		 541 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 639 aa  172  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 542 aa  171  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 544 aa  169  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 548 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 548 aa  161  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  31.44 
 
 		 548 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  36.31 
 
 		 560 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 641 aa  158  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  31.14 
 
 		 626 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  35.83 
 
 		 584 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 919 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  32.93 
 
 		 627 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 586 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  32.93 
 
 		 627 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  32.93 
 
 		 627 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  32.93 
 
 		 627 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  32.93 
 
 		 627 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  32.93 
 
 		 627 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  32.93 
 
 		 627 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 584 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0638  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 373 aa  150  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  39.15 
 
 		 313 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  32.71 
 
 		 531 aa  148  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.98 
 
 		 598 aa  148  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3901  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 661 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0390399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  38.62 
 
 		 912 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 588 aa  146  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 862 aa  145  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  35.45 
 
 		 358 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 1021 aa  144  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  36.91 
 
 		 556 aa  143  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 544 aa  143  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  35.76 
 
 		 358 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 589 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1465 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  35.76 
 
 		 389 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 389 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1802  histidine kinase  36.21 
 
 		 540 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963501  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  36.96 
 
 		 608 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  34.85 
 
 		 389 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 557 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1728  histidine kinase  36.21 
 
 		 560 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  34.85 
 
 		 389 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  34.85 
 
 		 389 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 488 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  34.85 
 
 		 358 aa  142  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 594 aa  142  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  34.21 
 
 		 308 aa  141  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 408 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>