More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5559 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5559  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 
752 aa  1506    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.74 
 
 
752 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.66 
 
 
747 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.34 
 
 
747 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.47 
 
 
747 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  38.3 
 
 
465 aa  163  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  38.3 
 
 
458 aa  163  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  37.87 
 
 
458 aa  162  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  37.87 
 
 
458 aa  161  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  41.96 
 
 
367 aa  161  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  37.45 
 
 
458 aa  161  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 
364 aa  160  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  41.47 
 
 
369 aa  159  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  40.16 
 
 
363 aa  158  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  37.45 
 
 
458 aa  157  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.84 
 
 
362 aa  157  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  37.02 
 
 
458 aa  156  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  37.02 
 
 
458 aa  156  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
372 aa  155  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.56 
 
 
578 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.68 
 
 
457 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
367 aa  154  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  41.02 
 
 
367 aa  154  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  33.02 
 
 
604 aa  154  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.02 
 
 
604 aa  154  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 
661 aa  153  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.96 
 
 
365 aa  153  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  39.68 
 
 
502 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 
502 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  39.27 
 
 
661 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  39.39 
 
 
672 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
672 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  36.16 
 
 
487 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  34.33 
 
 
517 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
494 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  39.92 
 
 
501 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.92 
 
 
598 aa  149  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1992  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
372 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
491 aa  147  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3078  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.63 
 
 
369 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  34.89 
 
 
614 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2806  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.48 
 
 
361 aa  146  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  34.71 
 
 
465 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  39.67 
 
 
419 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1404  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.48 
 
 
361 aa  146  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236023 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  34.71 
 
 
465 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.8 
 
 
491 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  34.3 
 
 
465 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
575 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  34.3 
 
 
465 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0128  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
780 aa  144  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000607213  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 
412 aa  144  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  36.21 
 
 
234 aa  143  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0283  sensor histidine kinase  34.46 
 
 
600 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
422 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  33.88 
 
 
465 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0905  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.82 
 
 
360 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0340364  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.69 
 
 
608 aa  141  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
586 aa  142  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  34.69 
 
 
608 aa  141  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  34.69 
 
 
608 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  34.69 
 
 
608 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  36.04 
 
 
1379 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 
1168 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  34.69 
 
 
608 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3457  ATP-binding region, ATPase-like protein  38.29 
 
 
345 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0871385  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
662 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
1519 aa  140  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4190  nitrogen regulation protein NR(II)  37.17 
 
 
349 aa  140  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.497456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0026  nitrogen regulation protein NR(II)  37.17 
 
 
349 aa  140  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.968773  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
738 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0028  nitrogen regulation protein NR(II)  37.17 
 
 
349 aa  140  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4882  nitrogen regulation protein NR(II)  36.96 
 
 
349 aa  139  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191848  hitchhiker  0.00011549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1993  two component sensor histidine kinase  35.12 
 
 
366 aa  139  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0015  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.84 
 
 
350 aa  139  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327507  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
592 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.18 
 
 
490 aa  139  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
368 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  34.69 
 
 
581 aa  138  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  34.43 
 
 
608 aa  138  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3279  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
608 aa  137  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00154728  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.86 
 
 
679 aa  138  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1650  histidine kinase  35.93 
 
 
612 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2449  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.71 
 
 
365 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000168694  normal  0.861586 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
673 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2562  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.7 
 
 
363 aa  137  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4221  nitrogen regulation protein NR(II)  37.39 
 
 
349 aa  137  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
855 aa  137  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2127  histidine kinase  34.05 
 
 
483 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4504  nitrogen regulation protein NR(II)  37.39 
 
 
349 aa  137  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
395 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
557 aa  136  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3245  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.23 
 
 
860 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48627  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
372 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.39 
 
 
547 aa  135  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
378 aa  135  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1745  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.89 
 
 
424 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
492 aa  135  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>