More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2146 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  100 
 
 
559 aa  1133    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.74 
 
 
547 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  40.11 
 
 
550 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2679  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 
544 aa  349  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.82 
 
 
538 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.94 
 
 
539 aa  334  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
549 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
543 aa  325  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
582 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
525 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
525 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
526 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.58 
 
 
546 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0119  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
571 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.412791  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1389  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.34 
 
 
550 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.531963  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
855 aa  195  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  33.89 
 
 
621 aa  192  9e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
378 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.83 
 
 
679 aa  181  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  40.87 
 
 
367 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.32 
 
 
598 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
680 aa  169  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
804 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
592 aa  169  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
367 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  30.25 
 
 
363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3120  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.23 
 
 
561 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.3 
 
 
578 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0184  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.34 
 
 
555 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37523  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
595 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  31.9 
 
 
608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.9 
 
 
608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  31.9 
 
 
608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  31.9 
 
 
608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  31.9 
 
 
608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  38.8 
 
 
369 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  32 
 
 
608 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  37.1 
 
 
581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  30.48 
 
 
614 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3785  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.69 
 
 
611 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.862005  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3869  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.69 
 
 
611 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.793663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 
364 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.3 
 
 
365 aa  163  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1658  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.69 
 
 
579 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0362267  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
801 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  31.71 
 
 
853 aa  161  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  31.66 
 
 
975 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3728  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.95 
 
 
613 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
970 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.98 
 
 
556 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.25 
 
 
581 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  36.08 
 
 
852 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
546 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00093231 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
722 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100019 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  37.83 
 
 
367 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
372 aa  157  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.55 
 
 
604 aa  156  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
852 aa  156  8e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2848  histidine kinase  35.21 
 
 
481 aa  156  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2698  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
438 aa  156  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
564 aa  156  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  39.04 
 
 
458 aa  156  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.89 
 
 
744 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  31.55 
 
 
604 aa  156  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
372 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  38.6 
 
 
458 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  31.29 
 
 
595 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.81 
 
 
362 aa  154  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  30.97 
 
 
595 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
551 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2148  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
729 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
671 aa  153  7e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  33.15 
 
 
613 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 
769 aa  153  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  37.89 
 
 
234 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
492 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.26 
 
 
491 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
540 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.18 
 
 
679 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.77 
 
 
367 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  38.16 
 
 
458 aa  152  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  36.44 
 
 
499 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  34.02 
 
 
617 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
491 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  38.16 
 
 
458 aa  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  30.65 
 
 
595 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  30.65 
 
 
595 aa  151  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  30.65 
 
 
595 aa  151  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.21 
 
 
490 aa  151  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 
802 aa  150  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  37.72 
 
 
458 aa  150  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  37.72 
 
 
458 aa  150  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.5 
 
 
752 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3327  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
510 aa  150  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.26559  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  35.27 
 
 
548 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 
695 aa  150  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.51 
 
 
747 aa  150  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.1 
 
 
363 aa  150  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
548 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
586 aa  150  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>