More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0905 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0905  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 
360 aa  743    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0340364  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2542  nitrogen regulation protein NR(II)  39.48 
 
 
364 aa  252  6e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3457  ATP-binding region, ATPase-like protein  40.35 
 
 
345 aa  251  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0871385  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0015  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.57 
 
 
350 aa  250  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327507  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1216  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.46 
 
 
357 aa  247  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0321  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.07 
 
 
345 aa  245  8e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0245  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.29 
 
 
365 aa  245  9e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3261  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.65 
 
 
355 aa  243  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5858  two-component sensor NtrB  38.04 
 
 
358 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4650  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.08 
 
 
348 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.617913 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3426  nitrogen regulation protein  39.71 
 
 
348 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.204004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0259  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.79 
 
 
348 aa  238  9e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.627159  hitchhiker  0.00000191471 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0258  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.79 
 
 
348 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3763  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.79 
 
 
348 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67670  two-component sensor NtrB  38.04 
 
 
358 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3560  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.13 
 
 
351 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0259  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.79 
 
 
348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0735  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.93 
 
 
385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0331289  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0267  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.79 
 
 
348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
362 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0767  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.1 
 
 
374 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0262  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.51 
 
 
348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.507954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0267  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.51 
 
 
348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4471  nitrogen regulation protein  38.51 
 
 
348 aa  232  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0283  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.26 
 
 
346 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000323653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3929  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.66 
 
 
346 aa  230  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
357 aa  229  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000409707  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4821  sensor histidine kinase  37.14 
 
 
361 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0340  Signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.02 
 
 
361 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4922  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.14 
 
 
361 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5100  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.14 
 
 
361 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3759  sensor histidine kinase  39.18 
 
 
356 aa  228  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0353  nitrogen regulation protein NtrB  37.14 
 
 
361 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01589  nitrogen regulation protein NR(II)  37.36 
 
 
361 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5047  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.86 
 
 
361 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2449  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.23 
 
 
365 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000168694  normal  0.861586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45890  histidine protein kinase, nitrogen regulation protein NtrB (NR(II))  38.35 
 
 
361 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.62 
 
 
348 aa  226  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0416  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.73 
 
 
361 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.994306 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2768  nitrogen regulation protein  38.48 
 
 
395 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2633  nitrogen regulation protein NR(II)  38.48 
 
 
380 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.90491  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3068  nitrogen regulation protein NR(II)  38.48 
 
 
380 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1741  nitrogen regulation protein  38.48 
 
 
357 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.546015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5457  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.92 
 
 
380 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1845  nitrogen regulation protein  38.2 
 
 
395 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1523  nitrogen regulation protein NR(II)  38.48 
 
 
380 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2251  nitrogen regulation protein NR(II)  38.48 
 
 
380 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2689  nitrogen regulation protein NR(II)  38.48 
 
 
380 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03754  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with GlnG  37.5 
 
 
349 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4096  nitrogen regulation protein NR(II)  37.5 
 
 
349 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4117  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.5 
 
 
349 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4147  nitrogen regulation protein NR(II)  37.5 
 
 
349 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2166  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.36 
 
 
380 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4288  nitrogen regulation protein NR(II)  37.9 
 
 
349 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2058  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.64 
 
 
380 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.778281  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5929  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.36 
 
 
380 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.516447  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2185  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.64 
 
 
380 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374753  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2148  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.36 
 
 
380 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5315  nitrogen regulation protein NR(II)  37.5 
 
 
349 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.962522  normal  0.565649 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03703  hypothetical protein  37.5 
 
 
349 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4391  nitrogen regulation protein NR(II)  37.5 
 
 
349 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.132536  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4217  nitrogen regulation protein NR(II)  37.9 
 
 
349 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732813  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4334  nitrogen regulation protein NR(II)  37.9 
 
 
349 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4238  nitrogen regulation protein NR(II)  37.9 
 
 
349 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.893304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4254  nitrogen regulation protein NR(II)  37.5 
 
 
349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.388785 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4395  nitrogen regulation protein NR(II)  37.9 
 
 
349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2320  nitrogen regulation protein NR(II)  35.28 
 
 
354 aa  215  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001907  nitrogen regulation protein NR(II)  35.09 
 
 
348 aa  215  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4345  nitrogen regulation protein NR(II)  37.21 
 
 
349 aa  215  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4882  nitrogen regulation protein NR(II)  36.34 
 
 
349 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191848  hitchhiker  0.00011549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3650  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.8 
 
 
358 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.051036  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2902  nitrogen regulation protein NR(II)  35.8 
 
 
361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2520  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.8 
 
 
361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4190  nitrogen regulation protein NR(II)  36.63 
 
 
349 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.497456  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0028  nitrogen regulation protein NR(II)  36.63 
 
 
349 aa  212  7e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0026  nitrogen regulation protein NR(II)  36.63 
 
 
349 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.968773  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1123  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.03 
 
 
393 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25113 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00585  nitrogen regulation protein NR(II)  34.62 
 
 
336 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1523  putative nitrogen regulation, histidine kinase, protein NR(II)  36.9 
 
 
380 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000460807  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0049  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.36 
 
 
365 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2501  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
363 aa  209  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0257  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.25 
 
 
381 aa  208  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4097  nitrogen regulation protein NR(II)  36.92 
 
 
349 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2614  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.9 
 
 
380 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.082338  normal  0.678018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1480  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.62 
 
 
380 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4221  nitrogen regulation protein NR(II)  37.32 
 
 
349 aa  205  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314539  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4504  nitrogen regulation protein NR(II)  36.73 
 
 
349 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3961  nitrogen regulation protein NR(II)  37.32 
 
 
349 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4158  nitrogen regulation protein NR(II)  36.73 
 
 
349 aa  202  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.128409  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0398  nitrogen regulation protein NR(II)  34.2 
 
 
371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.737334  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2074  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.24 
 
 
373 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.673281 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1027  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.29 
 
 
359 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2981  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.96 
 
 
368 aa  192  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3487  sensor histidine kinase  34.1 
 
 
356 aa  189  7e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0596493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2778  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.96 
 
 
365 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.549805  normal  0.0478149 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1191  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.94 
 
 
362 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.310962  normal  0.462311 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1111  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.94 
 
 
362 aa  187  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5000  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.24 
 
 
358 aa  187  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2055  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.07 
 
 
393 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3152  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.99 
 
 
363 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.806618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>