More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0110 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
592 aa  1206    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2148  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.53 
 
 
729 aa  505  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.41 
 
 
679 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.27 
 
 
598 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 
586 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.83 
 
 
604 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  38.83 
 
 
604 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0824  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.93 
 
 
616 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125796 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
673 aa  342  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
595 aa  332  9e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0186  sensor protein ZraS  61.98 
 
 
521 aa  260  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  51.68 
 
 
450 aa  231  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  49.58 
 
 
458 aa  227  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  49.58 
 
 
458 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  49.15 
 
 
458 aa  227  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  49.15 
 
 
465 aa  226  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  49.15 
 
 
458 aa  226  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  49.58 
 
 
458 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  49.15 
 
 
458 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  49.15 
 
 
458 aa  224  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  37.78 
 
 
621 aa  223  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  46.78 
 
 
465 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  47.21 
 
 
465 aa  210  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  46.78 
 
 
465 aa  210  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  47.21 
 
 
465 aa  210  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  47.21 
 
 
465 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
722 aa  208  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100019 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
564 aa  207  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  36.87 
 
 
550 aa  203  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1658  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.52 
 
 
579 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0362267  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  35.51 
 
 
611 aa  200  5e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
581 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0799101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03833  hypothetical protein  50 
 
 
422 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0772561  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  34.39 
 
 
613 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  33.71 
 
 
363 aa  193  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.8 
 
 
547 aa  193  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.82 
 
 
362 aa  192  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  30.23 
 
 
614 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.9 
 
 
365 aa  186  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0969  sensory histidine kinase AtoS  28.6 
 
 
622 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000351141  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.23 
 
 
578 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
559 aa  183  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  30.24 
 
 
608 aa  182  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.24 
 
 
608 aa  182  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  30.24 
 
 
608 aa  182  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  30.24 
 
 
608 aa  182  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  30.24 
 
 
608 aa  182  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1404  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.28 
 
 
361 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236023 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  31.28 
 
 
611 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  30.24 
 
 
608 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  32.41 
 
 
617 aa  179  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2806  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.17 
 
 
361 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  41.56 
 
 
367 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.79 
 
 
581 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.62 
 
 
539 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
855 aa  177  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 
367 aa  177  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.08 
 
 
538 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
582 aa  174  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1745  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.78 
 
 
424 aa  174  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3078  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.76 
 
 
369 aa  173  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  39.57 
 
 
234 aa  173  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2391  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
573 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000390402  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
689 aa  171  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  36.74 
 
 
517 aa  170  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
494 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
515 aa  169  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
372 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2562  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.9 
 
 
363 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  37.69 
 
 
531 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
680 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3279  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
608 aa  163  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00154728  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  38.26 
 
 
487 aa  163  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  39.48 
 
 
369 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  34.02 
 
 
581 aa  163  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
682 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
525 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
378 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.85 
 
 
747 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
526 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39 
 
 
747 aa  161  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3728  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.96 
 
 
613 aa  161  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  39.06 
 
 
674 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.85 
 
 
747 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
540 aa  160  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  36.19 
 
 
499 aa  160  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3327  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 
510 aa  160  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.26559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  39.83 
 
 
367 aa  160  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  36.44 
 
 
655 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3869  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.4 
 
 
611 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.793663  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
525 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2307  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
506 aa  159  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0979  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
617 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
491 aa  158  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2304  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
460 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.757006  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
372 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1993  two component sensor histidine kinase  30.49 
 
 
366 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0283  sensor histidine kinase  36.26 
 
 
600 aa  157  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  35.71 
 
 
522 aa  157  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
631 aa  157  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>