More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1004 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  100 
 
 
363 aa  730    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2562  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  80.17 
 
 
363 aa  557  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  72.3 
 
 
362 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2806  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  68.8 
 
 
361 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1404  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  68.8 
 
 
361 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236023 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3078  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  62.92 
 
 
369 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  60.17 
 
 
365 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1993  two component sensor histidine kinase  49.3 
 
 
366 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3671  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.97 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  35.31 
 
 
608 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  35.31 
 
 
608 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.31 
 
 
608 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  35.31 
 
 
608 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  35.31 
 
 
608 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  35.31 
 
 
608 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.77 
 
 
581 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  34.38 
 
 
604 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.38 
 
 
604 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
855 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.45 
 
 
679 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  36.68 
 
 
613 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4405  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.61 
 
 
363 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198423  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.82 
 
 
598 aa  206  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  34.53 
 
 
621 aa  202  7e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4382  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.48 
 
 
363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  33.43 
 
 
617 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 
586 aa  192  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
525 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0015  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.47 
 
 
350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327507  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4398  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.59 
 
 
351 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.269001 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.13 
 
 
546 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1216  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.43 
 
 
357 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
525 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4821  sensor histidine kinase  33.71 
 
 
361 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
970 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0353  nitrogen regulation protein NtrB  33.71 
 
 
361 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
526 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  41.74 
 
 
465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  41.74 
 
 
465 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2542  nitrogen regulation protein NR(II)  34.88 
 
 
364 aa  184  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  41.74 
 
 
465 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  41.74 
 
 
465 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  31.74 
 
 
550 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0340  Signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.43 
 
 
361 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  42.15 
 
 
465 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 
673 aa  182  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 
929 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
362 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0824  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.97 
 
 
616 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5858  two-component sensor NtrB  33.43 
 
 
358 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67670  two-component sensor NtrB  33.7 
 
 
358 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2520  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.64 
 
 
361 aa  179  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2902  nitrogen regulation protein NR(II)  34.64 
 
 
361 aa  179  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5047  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.26 
 
 
361 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3261  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.98 
 
 
355 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0767  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.52 
 
 
374 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.54 
 
 
367 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.12 
 
 
547 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1658  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 
579 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0362267  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4922  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.99 
 
 
361 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5100  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.99 
 
 
361 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3130  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.62 
 
 
371 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0945514  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  40.41 
 
 
458 aa  177  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.17 
 
 
367 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1578  histidine kinase  33.52 
 
 
829 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  31.27 
 
 
614 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  34.08 
 
 
830 aa  175  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.18 
 
 
578 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  40 
 
 
458 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  40 
 
 
458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  40.41 
 
 
458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
582 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
804 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  32.5 
 
 
1092 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2577  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.79 
 
 
390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00911748  normal  0.381184 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  40 
 
 
465 aa  173  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2148  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
729 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
592 aa  173  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2320  nitrogen regulation protein NR(II)  31.48 
 
 
354 aa  173  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 
738 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
829 aa  172  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  42.19 
 
 
367 aa  172  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0416  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.44 
 
 
361 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.994306 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  40.41 
 
 
458 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
491 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  40.41 
 
 
458 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  40 
 
 
458 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3869  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 
611 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.793663  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45890  histidine protein kinase, nitrogen regulation protein NtrB (NR(II))  32.28 
 
 
361 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.55 
 
 
744 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0735  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.15 
 
 
385 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0331289  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  39.27 
 
 
674 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.53 
 
 
1215 aa  170  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3344  sporulation kinase A  30.3 
 
 
510 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2589  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.34 
 
 
390 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal  0.0145748 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3432  sporulation kinase A  30.77 
 
 
510 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0123298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3702  sporulation kinase A  30.77 
 
 
510 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2883  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.51 
 
 
389 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.703794  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3393  sporulation kinase A  30.3 
 
 
510 aa  169  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.785669  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
722 aa  169  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>