More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2492 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  100 
 
 
830 aa  1673    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.3 
 
 
839 aa  868    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00645827  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1578  histidine kinase  59.23 
 
 
829 aa  992    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.5 
 
 
829 aa  991    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  64.17 
 
 
832 aa  1120    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2811  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
829 aa  197  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
749 aa  191  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  30.89 
 
 
613 aa  187  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  32.91 
 
 
621 aa  187  8e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0812  nitrogen regulation protein NtrY, putative  29.23 
 
 
748 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.439119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
738 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  32.99 
 
 
617 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
586 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 
673 aa  184  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 
731 aa  182  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  27.09 
 
 
614 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
737 aa  177  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  36.42 
 
 
611 aa  177  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  34.08 
 
 
363 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.7 
 
 
365 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 
746 aa  174  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.2 
 
 
604 aa  174  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  29.75 
 
 
604 aa  173  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
689 aa  172  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
540 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
619 aa  171  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.81 
 
 
679 aa  171  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
733 aa  170  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
595 aa  169  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 
422 aa  169  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.75 
 
 
598 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  39.04 
 
 
458 aa  169  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  39.04 
 
 
458 aa  168  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  39.04 
 
 
458 aa  168  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3361  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
756 aa  168  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3078  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.16 
 
 
369 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  40.93 
 
 
517 aa  167  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
680 aa  167  9e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  38.6 
 
 
458 aa  167  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  38.6 
 
 
458 aa  167  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  38.6 
 
 
458 aa  167  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  38.6 
 
 
465 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
494 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
748 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
756 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0285475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
756 aa  165  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.361287  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.97 
 
 
362 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
522 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
736 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  29.29 
 
 
611 aa  164  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
476 aa  164  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
903 aa  162  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2344  two component signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 
752 aa  162  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000619377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
607 aa  162  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
390 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 
631 aa  163  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  42.04 
 
 
587 aa  163  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1970  sensory box histidine kinase  28.85 
 
 
415 aa  162  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.645732  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  37.35 
 
 
499 aa  162  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
489 aa  162  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
738 aa  161  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
855 aa  161  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
729 aa  161  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  37.72 
 
 
458 aa  161  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.86 
 
 
516 aa  160  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  24.68 
 
 
845 aa  160  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
543 aa  160  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  39.46 
 
 
369 aa  160  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1088  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.94 
 
 
822 aa  160  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.436726 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  39.24 
 
 
484 aa  160  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.15 
 
 
578 aa  160  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
491 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
402 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
364 aa  159  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  38.46 
 
 
500 aa  159  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
671 aa  159  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0819  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.47 
 
 
393 aa  159  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.31 
 
 
546 aa  159  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  28.47 
 
 
608 aa  158  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.47 
 
 
608 aa  158  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
591 aa  158  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  28.47 
 
 
608 aa  158  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  28.47 
 
 
608 aa  158  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2148  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
729 aa  157  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  28.47 
 
 
608 aa  157  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4160  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.12 
 
 
516 aa  157  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
819 aa  157  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0233  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
553 aa  157  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446176  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 
736 aa  157  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  28.47 
 
 
608 aa  157  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  37.1 
 
 
516 aa  157  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 
804 aa  156  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
733 aa  156  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
498 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
515 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
845 aa  156  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468501 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  40.17 
 
 
542 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.69 
 
 
744 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  38.6 
 
 
234 aa  155  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  40.09 
 
 
412 aa  155  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>