More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0750 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
390 aa  797    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 
491 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 
494 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  39.18 
 
 
517 aa  216  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  37.99 
 
 
499 aa  212  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  36.14 
 
 
487 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.29 
 
 
457 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  34.19 
 
 
502 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
502 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  36.18 
 
 
501 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  38.72 
 
 
458 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  38.72 
 
 
458 aa  186  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  38.72 
 
 
458 aa  186  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  38.72 
 
 
465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  38.72 
 
 
458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  38.72 
 
 
458 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  38.3 
 
 
458 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  38.46 
 
 
465 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  38.03 
 
 
465 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  38.3 
 
 
458 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  38.03 
 
 
465 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  38.03 
 
 
465 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  38.03 
 
 
465 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
522 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
691 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  37.62 
 
 
542 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  33.54 
 
 
490 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  34.32 
 
 
674 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  34.11 
 
 
516 aa  169  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.73 
 
 
541 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  36.27 
 
 
560 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2127  histidine kinase  32.55 
 
 
483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0096  histidine kinase  37.74 
 
 
525 aa  167  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
488 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
662 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
480 aa  166  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  32.62 
 
 
673 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  32.79 
 
 
656 aa  166  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  40 
 
 
608 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
656 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
630 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  40.42 
 
 
608 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.42 
 
 
608 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  39.45 
 
 
234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  40.42 
 
 
608 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  40.42 
 
 
608 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
542 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  40.42 
 
 
608 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
586 aa  164  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
655 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
661 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  38.75 
 
 
604 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.75 
 
 
604 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
655 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  32.9 
 
 
500 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  37.5 
 
 
830 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 
738 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
586 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 
492 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
672 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
592 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
584 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.43 
 
 
365 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.39 
 
 
598 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  35.42 
 
 
592 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
476 aa  160  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
544 aa  159  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  37.89 
 
 
369 aa  159  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  33.15 
 
 
672 aa  158  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
654 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  36.17 
 
 
627 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
658 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  33.11 
 
 
655 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
492 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  38.43 
 
 
363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
832 aa  156  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36 
 
 
679 aa  156  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
646 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  35.17 
 
 
626 aa  155  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  32.05 
 
 
468 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  40.5 
 
 
621 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
829 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  35.82 
 
 
627 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  35.82 
 
 
627 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  30.92 
 
 
531 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4226  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
613 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
396 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  35.82 
 
 
627 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  35.82 
 
 
627 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  35.82 
 
 
627 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  35.82 
 
 
627 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  31.54 
 
 
661 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1578  histidine kinase  38.63 
 
 
829 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  39.65 
 
 
367 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
1519 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03833  hypothetical protein  38.89 
 
 
422 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0772561  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
510 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
518 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  36.29 
 
 
617 aa  153  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
396 aa  153  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>