More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0471 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  100 
 
 
419 aa  830    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.63 
 
 
422 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  47.76 
 
 
412 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.25 
 
 
412 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3414  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.1 
 
 
406 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.5 
 
 
415 aa  342  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  34.63 
 
 
458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  34.63 
 
 
458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  34.35 
 
 
458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  34.35 
 
 
458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  34.35 
 
 
458 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  34.35 
 
 
458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  33.85 
 
 
450 aa  180  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  34.07 
 
 
458 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.05 
 
 
367 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.64 
 
 
747 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  33.42 
 
 
465 aa  172  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.64 
 
 
747 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.21 
 
 
747 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  43.42 
 
 
367 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.2 
 
 
752 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.37 
 
 
598 aa  167  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.25 
 
 
679 aa  166  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  36.18 
 
 
550 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 
378 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.06 
 
 
547 aa  163  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  40.09 
 
 
369 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  43.42 
 
 
367 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
491 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
364 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  41.15 
 
 
674 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2293  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.67 
 
 
782 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3007  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.71 
 
 
507 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.738719  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  41.45 
 
 
465 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.05 
 
 
578 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  41.45 
 
 
465 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  41.03 
 
 
465 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
480 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  41.03 
 
 
465 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  41.03 
 
 
465 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
738 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.71 
 
 
604 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 
671 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 
691 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03833  hypothetical protein  33.84 
 
 
422 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0772561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
832 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
662 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1250  histidine kinase  30.8 
 
 
498 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.792826  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  35.34 
 
 
604 aa  156  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  39.92 
 
 
499 aa  156  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  33.69 
 
 
608 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.69 
 
 
608 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  33.69 
 
 
608 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  33.69 
 
 
608 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  41.15 
 
 
673 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  33.69 
 
 
608 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  40.17 
 
 
363 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0186  sensor protein ZraS  33.51 
 
 
521 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
595 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3957  sensor histidine kinase KinD  30.42 
 
 
498 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.5608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
970 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
430 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  38.7 
 
 
517 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.09 
 
 
367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1387  sensor histidine kinase KinD  30.42 
 
 
498 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 
1519 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  33.69 
 
 
608 aa  154  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  39.21 
 
 
661 aa  153  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  41.15 
 
 
621 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
515 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1225  sensor histidine kinase; sporulation kinase  30.42 
 
 
498 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.485232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  36.76 
 
 
830 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1424  sensor histidine kinase KinD  30.42 
 
 
498 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267919 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1449  sensor histidine kinase KinD  30.42 
 
 
498 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2148  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 
729 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1227  sensor histidine kinase; sporulation kinase  30.42 
 
 
498 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 
479 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3229  histidine kinase  33.03 
 
 
610 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0740386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1490  sensor histidine kinase KinD  30.42 
 
 
498 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.82 
 
 
490 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.4 
 
 
365 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2708  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
424 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0369764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1252  sensor histidine kinase KinD  30.04 
 
 
498 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1351  sensor histidine kinase KinD  30.04 
 
 
498 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3099  sensor histidine kinase  38.77 
 
 
591 aa  150  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.564011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 
372 aa  149  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
494 aa  149  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
661 aa  149  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  37.66 
 
 
613 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.51 
 
 
744 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  38.79 
 
 
487 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
540 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  33.76 
 
 
581 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
498 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0672  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
689 aa  147  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0672  histidine kinase  43.29 
 
 
373 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 
440 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.139517 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1269  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.91 
 
 
509 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1993  two component sensor histidine kinase  39.24 
 
 
366 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>