More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1269 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1269  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 		 509 aa  1046    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3007  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  49.11 
 
 		 507 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.738719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.11 
 
 		 627 aa  312  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0530  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.83 
 
 		 579 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.82222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1918  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.63 
 
 		 535 aa  309  9e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.723955  normal  0.316434 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.47 
 
 		 546 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00093231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2304  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 		 460 aa  306  6e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.757006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0091  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.88 
 
 		 686 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101658 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.03 
 
 		 556 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1525  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.83 
 
 		 653 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3834  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  60.67 
 
 		 908 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2293  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.48 
 
 		 782 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0427  sensor histidine kinase, putative  58.72 
 
 		 676 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0590994  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 612 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1054  Signal transduction histidine kinase nitrogen specific-like protein  43.92 
 
 		 493 aa  289  8e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.87 
 
 		 672 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0307  sensor histidine kinase (sporulation kinase), C-terminal region  54.26 
 
 		 677 aa  286  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0303  sensor histidine kinase; sporulation kinase  54.26 
 
 		 677 aa  285  9e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00332628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0367  sensor histidine kinase  57.02 
 
 		 672 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5581  sensor histidine kinase  56.17 
 
 		 672 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5365  sensor histidine kinase  56.17 
 
 		 672 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00212715  hitchhiker  0.0000000443209 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1918  Signal transduction histidine kinase-like protein  55.88 
 
 		 878 aa  270  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1253  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.9 
 
 		 638 aa  262  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000228716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3229  histidine kinase  52.34 
 
 		 610 aa  257  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0740386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0916  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.83 
 
 		 599 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000947728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 680 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3094  histidine kinase  47.2 
 
 		 246 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 664 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 		 696 aa  211  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.94 
 
 		 688 aa  209  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  29 
 
 		 702 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  29.39 
 
 		 695 aa  206  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.88 
 
 		 663 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 		 695 aa  201  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.96 
 
 		 578 aa  193  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.35 
 
 		 744 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 738 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 		 990 aa  183  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 978 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 		 803 aa  179  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 562 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1651  PAS sensor protein  28.68 
 
 		 895 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.13 
 
 		 632 aa  173  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.04 
 
 		 963 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.66 
 
 		 1215 aa  167  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.46 
 
 		 365 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.11 
 
 		 716 aa  165  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749109 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2889  sensory transduction histidine kinase; sporulation kinase A  29.59 
 
 		 801 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.516791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3143  sporulation kinase  29.59 
 
 		 801 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.564779 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3122  sporulation kinase  28.77 
 
 		 801 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2115  sporulation kinase  27.61 
 
 		 801 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.13 
 
 		 975 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4048  response regulator receiver protein  55.1 
 
 		 241 aa  163  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.916406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 		 553 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0667  response regulator receiver protein  54.42 
 
 		 214 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0467725  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.11 
 
 		 622 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3338  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.8 
 
 		 526 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00782598 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0394  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 531 aa  159  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 595 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0288015  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.25 
 
 		 622 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 590 aa  158  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  27.25 
 
 		 622 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5651  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 801 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.285543 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5814  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 		 583 aa  156  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552615  normal  0.0161436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.84 
 
 		 688 aa  156  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.13 
 
 		 1509 aa  156  9e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1946  histidine kinase  63.48 
 
 		 150 aa  156  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  35.57 
 
 		 595 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  48.12 
 
 		 572 aa  153  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 503 aa  153  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  36.44 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  36.44 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 1131 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  36.44 
 
 		 595 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  36.44 
 
 		 595 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  38.36 
 
 		 234 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  29 
 
 		 613 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1745  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.82 
 
 		 424 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0324  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.99 
 
 		 424 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.046409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 712 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.6651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  36.91 
 
 		 595 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  36.02 
 
 		 595 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3916  sporulation kinase B  33.88 
 
 		 424 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651909  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3748  sporulation kinase B  33.88 
 
 		 424 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4025  sporulation kinase B  33.88 
 
 		 424 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4223  sporulation kinase B  33.88 
 
 		 424 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4058  sporulation kinase B  33.88 
 
 		 424 aa  150  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  30.88 
 
 		 621 aa  150  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3764  sporulation kinase B  33.88 
 
 		 424 aa  150  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.320466  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 		 699 aa  150  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1880  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 612 aa  150  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4131  sporulation kinase B  33.88 
 
 		 424 aa  150  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.91 
 
 		 519 aa  150  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 712 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4112  sporulation kinase B  33.06 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1127  sporulation kinase B  33.06 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.918455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0143  response regulator receiver protein  57.36 
 
 		 206 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 587 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  36.05 
 
 		 595 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.46 
 
 		 692 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>