More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2293 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2293  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 		 782 aa  1611    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1054  Signal transduction histidine kinase nitrogen specific-like protein  51.4 
 
 		 493 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 		 612 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1525  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.33 
 
 		 653 aa  333  6e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2304  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.86 
 
 		 460 aa  324  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.757006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0530  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.7 
 
 		 579 aa  321  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.82222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3007  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.24 
 
 		 507 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.738719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 		 627 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0091  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.11 
 
 		 686 aa  299  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101658 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1269  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.48 
 
 		 509 aa  295  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.35 
 
 		 556 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1253  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.25 
 
 		 638 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000228716  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 		 546 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00093231 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3229  histidine kinase  43.95 
 
 		 610 aa  283  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0740386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3834  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  57.69 
 
 		 908 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1918  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.63 
 
 		 878 aa  273  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1918  multi-sensor signal transduction histidine kinase  57.89 
 
 		 535 aa  270  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.723955  normal  0.316434 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0307  sensor histidine kinase (sporulation kinase), C-terminal region  49.8 
 
 		 677 aa  257  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0367  sensor histidine kinase  50.2 
 
 		 672 aa  258  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0303  sensor histidine kinase; sporulation kinase  49.8 
 
 		 677 aa  257  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00332628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0427  sensor histidine kinase, putative  49.8 
 
 		 676 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0590994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.58 
 
 		 672 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5581  sensor histidine kinase  48.99 
 
 		 672 aa  247  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5365  sensor histidine kinase  48.99 
 
 		 672 aa  247  8e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00212715  hitchhiker  0.0000000443209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0916  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  51.09 
 
 		 599 aa  239  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000947728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3094  histidine kinase  51.17 
 
 		 246 aa  213  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  27.57 
 
 		 1112 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2106  Signal transduction histidine kinase nitrogen specific-like protein  30.73 
 
 		 635 aa  191  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.92 
 
 		 578 aa  181  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 738 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 503 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2115  sporulation kinase  29.14 
 
 		 801 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 		 801 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3143  sporulation kinase  28.77 
 
 		 801 aa  164  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.564779 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2889  sensory transduction histidine kinase; sporulation kinase A  28.77 
 
 		 801 aa  164  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.516791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3122  sporulation kinase  28.86 
 
 		 801 aa  163  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  29.34 
 
 		 608 aa  161  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.34 
 
 		 608 aa  161  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  29.34 
 
 		 608 aa  161  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  29.34 
 
 		 608 aa  161  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  29.34 
 
 		 608 aa  161  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 		 711 aa  161  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  29.34 
 
 		 608 aa  161  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  37.67 
 
 		 419 aa  160  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.02 
 
 		 744 aa  160  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5651  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 801 aa  160  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.285543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 		 692 aa  159  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 		 692 aa  159  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  39.07 
 
 		 234 aa  159  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.81 
 
 		 819 aa  157  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  31.51 
 
 		 595 aa  156  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  31.79 
 
 		 595 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  31.79 
 
 		 595 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  31.79 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  31.79 
 
 		 509 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  31.79 
 
 		 595 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  31.59 
 
 		 595 aa  154  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 533 aa  154  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  31.53 
 
 		 621 aa  153  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2652  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.5 
 
 		 833 aa  152  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 		 995 aa  152  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3832  sporulation kinase  30.77 
 
 		 421 aa  151  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000527947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.9 
 
 		 365 aa  151  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 		 819 aa  151  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1880  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 612 aa  151  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 559 aa  151  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.34 
 
 		 1034 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.96 
 
 		 957 aa  150  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1583  sensor histidine kinase, putative  31.06 
 
 		 423 aa  150  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  29.36 
 
 		 590 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  29.86 
 
 		 595 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3327  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 510 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.26559  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0714  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 744 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 595 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0288015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  32.16 
 
 		 1258 aa  148  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 515 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1826  histidine kinase  36.84 
 
 		 418 aa  147  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.778764  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 673 aa  147  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1381  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.06 
 
 		 416 aa  146  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413033  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1339  sensor histidine kinase, C-terminal region; sporulation kinase  30.43 
 
 		 420 aa  146  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1619  sensor histidine kinase  30.43 
 
 		 423 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1340  sporulation kinase  30.12 
 
 		 420 aa  146  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.07 
 
 		 752 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.61 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2307  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 506 aa  145  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 		 677 aa  145  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 430 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0875  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 628 aa  145  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1513  sensor histidine kinase  30.89 
 
 		 423 aa  145  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2669  sporulation kinase B  34.31 
 
 		 389 aa  144  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3670  sporulation kinase A  28.85 
 
 		 510 aa  144  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.825905  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  30.32 
 
 		 1092 aa  144  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3674  sporulation kinase A  28.85 
 
 		 510 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.123371  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 492 aa  144  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 586 aa  143  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1550  sensor histidine kinase  30.12 
 
 		 420 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000335626 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1523  histidine kinase  36.89 
 
 		 437 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  34.65 
 
 		 367 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1946  histidine kinase  58.41 
 
 		 150 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1745  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.91 
 
 		 424 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>