More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2106 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2106  Signal transduction histidine kinase nitrogen specific-like protein  100 
 
 
635 aa  1303    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.99 
 
 
836 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0172365  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3519  putative PAS/PAC sensor protein  43.19 
 
 
757 aa  416  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.324252  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 
802 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1529  sensory box histidine kinase/response regulator  42.61 
 
 
803 aa  399  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.79 
 
 
953 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1428  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 
691 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 
1134 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.88 
 
 
929 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.25 
 
 
812 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
785 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.86 
 
 
769 aa  372  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 
1677 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.785659  normal  0.992917 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1306  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.66 
 
 
763 aa  353  8e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147703  normal  0.027228 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0066  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 
748 aa  350  6e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1840  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.55 
 
 
482 aa  349  9e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.366501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 
1004 aa  349  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
1004 aa  346  8e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 
709 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1747  histidine kinase  44.32 
 
 
1452 aa  319  9e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0967  histidine kinase  39.64 
 
 
1177 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0387  histidine kinase  44.19 
 
 
356 aa  296  8e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2469  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.13 
 
 
901 aa  293  8e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3116  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 
819 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1179  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.89 
 
 
777 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  31.95 
 
 
1112 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 
976 aa  269  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 
692 aa  261  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  39.95 
 
 
1788 aa  261  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 
692 aa  259  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
559 aa  259  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 
886 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 
759 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.63 
 
 
746 aa  242  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.877964  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
1260 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 
886 aa  239  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
1260 aa  239  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 
677 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  33.87 
 
 
882 aa  237  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 
673 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 
1509 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.61 
 
 
1113 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
869 aa  234  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 
634 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 
873 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 
1418 aa  232  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 
859 aa  232  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.94 
 
 
1108 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.38 
 
 
796 aa  231  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 
838 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 
639 aa  229  9e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
802 aa  229  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
1122 aa  227  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 
1023 aa  226  8e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0273  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 
917 aa  226  8e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 
853 aa  226  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  28.39 
 
 
844 aa  226  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
682 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 
796 aa  225  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 
817 aa  225  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 
576 aa  224  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 
1023 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.48 
 
 
860 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
997 aa  223  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 
869 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 
1222 aa  223  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 
997 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.89 
 
 
890 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0740  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
698 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.72 
 
 
1081 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 
810 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 
711 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.19 
 
 
714 aa  221  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
637 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
641 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
654 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
1022 aa  216  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 
1076 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
935 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 
673 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 
885 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 
829 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 
1432 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.38 
 
 
989 aa  214  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
828 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 
1428 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 
1184 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 
1184 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  30.06 
 
 
733 aa  213  7.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 
1040 aa  213  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
831 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 
803 aa  213  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 
914 aa  212  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
650 aa  211  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 
647 aa  210  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  33.5 
 
 
527 aa  209  9e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  31.57 
 
 
539 aa  209  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 
871 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
822 aa  209  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 
1021 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>