More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3223 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
440 aa  848    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.139517 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  43.64 
 
 
419 aa  156  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  36.54 
 
 
412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  35.14 
 
 
458 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  34.78 
 
 
458 aa  143  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  34.78 
 
 
458 aa  143  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  34.42 
 
 
458 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  34.42 
 
 
458 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 
525 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
525 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  34.06 
 
 
458 aa  139  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
526 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  34.42 
 
 
458 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
422 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  35.66 
 
 
465 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2148  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
729 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  36.01 
 
 
550 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  37.25 
 
 
367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3414  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
406 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  34.06 
 
 
661 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.17 
 
 
546 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
595 aa  127  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  28.88 
 
 
450 aa  126  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2378  histidine kinase  39.75 
 
 
418 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0564708  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  34.03 
 
 
465 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  32.79 
 
 
465 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03833  hypothetical protein  35.63 
 
 
422 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0772561  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  33.1 
 
 
465 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  33.1 
 
 
465 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  33.1 
 
 
465 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2698  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
438 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
661 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
582 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.44 
 
 
598 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  32.63 
 
 
604 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
372 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
1519 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  35.1 
 
 
367 aa  124  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  34.8 
 
 
369 aa  124  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.76 
 
 
491 aa  123  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.27 
 
 
547 aa  122  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.2 
 
 
604 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.71 
 
 
679 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
662 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  34.87 
 
 
611 aa  120  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
364 aa  120  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 
586 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  34.47 
 
 
530 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.47 
 
 
530 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  32.91 
 
 
621 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.02 
 
 
578 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  34.8 
 
 
674 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
367 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
689 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
498 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
415 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
673 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0186  sensor protein ZraS  28.05 
 
 
521 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4097  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
766 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
902 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5559  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.72 
 
 
752 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.05 
 
 
519 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
540 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0478  histidine kinase  32.56 
 
 
555 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  31.11 
 
 
614 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
581 aa  114  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
592 aa  114  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  37.04 
 
 
581 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0969  sensory histidine kinase AtoS  30.89 
 
 
622 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000351141  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
390 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4002  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
765 aa  113  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
832 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4402  histidine kinase  38.12 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
929 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
738 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0446  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 
1527 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
469 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0824  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.2 
 
 
616 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125796 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  33.63 
 
 
517 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 
1527 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 
1168 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0739  histidine kinase  32.49 
 
 
420 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  34.33 
 
 
608 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0656  histidine kinase  28.34 
 
 
417 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.572092 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.38 
 
 
679 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.88 
 
 
490 aa  110  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
581 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  37.1 
 
 
693 aa  109  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.91 
 
 
608 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  33.91 
 
 
608 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  33.91 
 
 
608 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
469 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00245745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  33.91 
 
 
608 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>