More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2932 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
394 aa  792    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  76.79 
 
 
396 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  76.02 
 
 
396 aa  608  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  71.02 
 
 
395 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1119  sensor histidine kinase/response regulator  69.29 
 
 
420 aa  547  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  57.14 
 
 
391 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  53.16 
 
 
399 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0437  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.93 
 
 
412 aa  328  8e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.148474  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0913  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 
544 aa  182  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 
522 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  39.04 
 
 
516 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2440  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 
375 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.627522 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  38.04 
 
 
560 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  40.16 
 
 
673 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  39.2 
 
 
674 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
586 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.05 
 
 
541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1327  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
375 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0403  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
374 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
584 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1360  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
403 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2532  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
375 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
408 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2628  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.7332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  32.78 
 
 
542 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  38.56 
 
 
611 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
542 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  35.63 
 
 
584 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
443 aa  159  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
970 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
548 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
518 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 
437 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
691 aa  156  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  38.26 
 
 
621 aa  156  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
492 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  35.37 
 
 
490 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
488 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3096  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
659 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  37.05 
 
 
830 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
661 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
738 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
515 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32 
 
 
578 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
589 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  37.9 
 
 
234 aa  153  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
586 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
570 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  37.24 
 
 
661 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
832 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0638  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
373 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.23 
 
 
744 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.42 
 
 
440 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1578  histidine kinase  35.27 
 
 
829 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
467 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  36.82 
 
 
614 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  34.96 
 
 
548 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0672  histidine kinase  35.63 
 
 
373 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
662 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
492 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
467 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
548 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4097  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
766 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  34.06 
 
 
531 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  31.09 
 
 
505 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  34.65 
 
 
458 aa  149  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0420  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
458 aa  149  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00956949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
829 aa  149  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
488 aa  149  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  34.65 
 
 
458 aa  149  9e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
594 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.77 
 
 
490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  34.21 
 
 
458 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
498 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  34.63 
 
 
465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  34.65 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
431 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0672  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  34.88 
 
 
600 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
602 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
475 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  34.65 
 
 
458 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
595 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  35.34 
 
 
313 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0247  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
407 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.433647 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  32.55 
 
 
667 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  26.71 
 
 
588 aa  146  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  36.03 
 
 
912 aa  147  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  34.21 
 
 
458 aa  146  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0283  sensor histidine kinase  33 
 
 
600 aa  146  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  34.8 
 
 
450 aa  146  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2115  sporulation kinase  35.34 
 
 
801 aa  146  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
611 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
611 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
655 aa  145  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
587 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4002  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
765 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3279  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
608 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00154728  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
368 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>