More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0582 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 587 aa  1199    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 702 aa  208  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0975  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 		 683 aa  208  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3718  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 		 826 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2548  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 		 861 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1222  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 686 aa  197  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583301 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 760 aa  196  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2710  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 756 aa  187  7e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.438958  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2370  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 672 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 522 aa  180  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 707 aa  175  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  37.98 
 
 		 516 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 671 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.918325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 542 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  36.11 
 
 		 542 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2283  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 643 aa  167  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 		 801 aa  166  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1799  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 1150 aa  166  9e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 408 aa  166  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 544 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0835  histidine kinase  34.93 
 
 		 418 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.882013  normal  0.0872609 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 592 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4833  sensory box histidine kinase  35.77 
 
 		 899 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  30.85 
 
 		 600 aa  162  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.07 
 
 		 541 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  36.46 
 
 		 592 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.67 
 
 		 999 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  40.41 
 
 		 1092 aa  161  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 921 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 		 844 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4373  PAS  35.77 
 
 		 907 aa  160  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323082  normal  0.21328 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 557 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2824  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 645 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  31.95 
 
 		 621 aa  159  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 552 aa  159  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 408 aa  159  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0638  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 373 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  36.76 
 
 		 647 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.1 
 
 		 1255 aa  159  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  37.11 
 
 		 1062 aa  159  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  30.51 
 
 		 626 aa  157  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 586 aa  157  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2152  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 834 aa  157  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  30.51 
 
 		 621 aa  157  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  36.06 
 
 		 659 aa  157  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 528 aa  157  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.828791  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 552 aa  156  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  34.25 
 
 		 912 aa  156  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 881 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 803 aa  156  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4291  sensor histidine kinase  31.88 
 
 		 585 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 		 850 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3096  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 659 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  31.55 
 
 		 623 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 630 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.941233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.94 
 
 		 819 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  31.68 
 
 		 616 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2233  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 552 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0296242 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 548 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 		 819 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 683 aa  154  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 852 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1987  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 552 aa  153  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0331  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 441 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301894 
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  36 
 
 		 853 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 591 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  37.11 
 
 		 556 aa  153  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 570 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  30.54 
 
 		 1850 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 662 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  32.99 
 
 		 548 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 668 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  36.5 
 
 		 313 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5498  histidine kinase  35.09 
 
 		 676 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 		 842 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 589 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  36.09 
 
 		 587 aa  151  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  33.83 
 
 		 1000 aa  151  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 594 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 691 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0039  histidine kinase  33.22 
 
 		 655 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 641 aa  151  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 850 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5205  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.97 
 
 		 727 aa  151  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.64 
 
 		 952 aa  151  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 548 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0672  histidine kinase  30.72 
 
 		 373 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 862 aa  150  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.06 
 
 		 1808 aa  150  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  36.43 
 
 		 737 aa  150  7e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 557 aa  150  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0050  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 871 aa  150  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0971682  decreased coverage  0.000571287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 1168 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 611 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 611 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  32.33 
 
 		 630 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  34.4 
 
 		 852 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2678  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 698 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.351001 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 630 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>