More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3374 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4694  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.95 
 
 		 991 aa  870    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000630671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4695  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.15 
 
 		 991 aa  872    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000969954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0965  sensor histidine kinase  47.12 
 
 		 982 aa  870    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0832  PAS  47.02 
 
 		 984 aa  851    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.05 
 
 		 991 aa  870    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  hitchhiker  0.0000734254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  47.93 
 
 		 982 aa  868    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1893  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 985 aa  713    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.426931  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0738  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 991 aa  875    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000340339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5442  two-component sensor CbrA  47.61 
 
 		 983 aa  888    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42670  Sensory histidine protein kinase CbrA  46.53 
 
 		 981 aa  865    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416099  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  100 
 
 		 1000 aa  2043    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.7 
 
 		 987 aa  761    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  39.98 
 
 		 975 aa  737    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62530  two-component sensor CbrA  47.61 
 
 		 983 aa  889    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3588  two-component sensor kinase CbrA  47.44 
 
 		 984 aa  861    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.883039 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1029  two-component sensor CbrA  43.08 
 
 		 986 aa  715    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211087  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 981 aa  607  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000864337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  27.87 
 
 		 1161 aa  276  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  27.26 
 
 		 1159 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  27.08 
 
 		 1159 aa  274  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  25.94 
 
 		 1157 aa  273  9e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.46 
 
 		 1159 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.36 
 
 		 1159 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.6 
 
 		 1159 aa  266  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 		 1158 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.67 
 
 		 1156 aa  264  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  25.85 
 
 		 1158 aa  257  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  28.22 
 
 		 1082 aa  254  8.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.36 
 
 		 1163 aa  253  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  24.93 
 
 		 1168 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  23.95 
 
 		 1323 aa  249  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  28.94 
 
 		 1083 aa  248  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0715  Na+/solute symporter  29.59 
 
 		 1039 aa  245  3.9999999999999997e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.723376  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.14 
 
 		 1145 aa  244  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  27.09 
 
 		 1148 aa  241  5e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 1071 aa  238  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.565561 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  26.27 
 
 		 1147 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.53 
 
 		 1172 aa  236  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  25.05 
 
 		 1177 aa  232  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1168 aa  231  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.07 
 
 		 1152 aa  230  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  30.6 
 
 		 1174 aa  229  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  29.24 
 
 		 903 aa  229  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  29.72 
 
 		 927 aa  229  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.32 
 
 		 1169 aa  228  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.41 
 
 		 1168 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 920 aa  227  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 		 1171 aa  225  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.36 
 
 		 1088 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  25.09 
 
 		 1169 aa  224  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 		 1316 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.69 
 
 		 1138 aa  221  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  26.61 
 
 		 1079 aa  219  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  24.91 
 
 		 1150 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  27.39 
 
 		 1087 aa  219  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.05 
 
 		 1156 aa  219  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 		 1323 aa  219  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  29.25 
 
 		 919 aa  218  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 919 aa  216  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  26.94 
 
 		 1087 aa  215  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1429  hypothetical protein  27.77 
 
 		 910 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.86 
 
 		 1175 aa  214  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.84 
 
 		 1168 aa  213  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.75 
 
 		 1172 aa  213  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2061  Na+/solute symporter  26.07 
 
 		 671 aa  210  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.274324 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  24.33 
 
 		 1169 aa  209  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 917 aa  209  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.16 
 
 		 1167 aa  209  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  28.94 
 
 		 906 aa  209  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  24.21 
 
 		 1179 aa  209  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  24.71 
 
 		 1055 aa  207  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  24.41 
 
 		 1006 aa  207  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 		 1169 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  25.91 
 
 		 1100 aa  205  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 932 aa  205  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  29.88 
 
 		 935 aa  205  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 		 1169 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 894 aa  204  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27583 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0169  Na+/solute symporter  29.66 
 
 		 894 aa  204  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827667  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 		 1169 aa  204  9e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.84 
 
 		 1174 aa  203  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.83 
 
 		 1168 aa  199  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  30.08 
 
 		 913 aa  199  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 896 aa  197  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.808684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 897 aa  196  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.263667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.46 
 
 		 1172 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1474  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 894 aa  196  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  23.32 
 
 		 1147 aa  196  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.43 
 
 		 1152 aa  194  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 893 aa  192  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  28.6 
 
 		 950 aa  193  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 1170 aa  192  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 885 aa  192  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00597808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.8 
 
 		 1146 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.89 
 
 		 1146 aa  192  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.89 
 
 		 1146 aa  191  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  23.79 
 
 		 1146 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.59 
 
 		 1140 aa  188  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.43 
 
 		 1159 aa  187  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.7 
 
 		 1146 aa  187  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>