More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0671 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4695  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.84 
 
 
991 aa  979    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000969954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0965  sensor histidine kinase  51.58 
 
 
982 aa  980    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0832  PAS  51.58 
 
 
984 aa  952    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253594 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 
981 aa  691    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000864337  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  51.53 
 
 
982 aa  951    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0738  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.74 
 
 
991 aa  979    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000340339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5442  two-component sensor CbrA  54.46 
 
 
983 aa  1013    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4694  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.95 
 
 
991 aa  977    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000630671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3588  two-component sensor kinase CbrA  53.64 
 
 
984 aa  1004    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.883039 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1893  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 
985 aa  705    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.426931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  42.7 
 
 
1000 aa  781    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
987 aa  1988    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1029  two-component sensor CbrA  45.06 
 
 
986 aa  727    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211087  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.74 
 
 
991 aa  976    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  hitchhiker  0.0000734254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42670  Sensory histidine protein kinase CbrA  54 
 
 
981 aa  984    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416099  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  43.27 
 
 
975 aa  732    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62530  two-component sensor CbrA  54.46 
 
 
983 aa  1015    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  29.13 
 
 
1161 aa  295  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 
1156 aa  295  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 
1159 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.61 
 
 
1159 aa  292  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.77 
 
 
1159 aa  290  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 
1158 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  28.31 
 
 
1159 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  28.22 
 
 
1159 aa  288  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  27.95 
 
 
1157 aa  281  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  26.18 
 
 
1323 aa  279  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  27.7 
 
 
1158 aa  274  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  36.43 
 
 
927 aa  261  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.91 
 
 
1168 aa  255  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  27.83 
 
 
1147 aa  253  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.51 
 
 
1163 aa  253  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  27.43 
 
 
1148 aa  250  7e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0715  Na+/solute symporter  31.64 
 
 
1039 aa  250  8e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.723376  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  30.46 
 
 
1083 aa  248  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.28 
 
 
1175 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  25.73 
 
 
950 aa  245  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.3 
 
 
1168 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.28 
 
 
1172 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.17 
 
 
1168 aa  241  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0169  Na+/solute symporter  36.32 
 
 
894 aa  240  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827667  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
894 aa  240  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.27583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
919 aa  237  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
897 aa  235  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.263667  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
893 aa  234  7.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194917  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.28 
 
 
1171 aa  229  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.19 
 
 
1179 aa  229  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  30.21 
 
 
1082 aa  226  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  31.46 
 
 
1177 aa  226  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1474  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
894 aa  225  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.51 
 
 
1316 aa  225  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  29.64 
 
 
903 aa  225  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  31.82 
 
 
1087 aa  224  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  24.98 
 
 
1150 aa  224  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.71 
 
 
1152 aa  223  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
1071 aa  223  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.565561 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  26.16 
 
 
1142 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  32.72 
 
 
906 aa  222  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  31.82 
 
 
1087 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
920 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  29.78 
 
 
919 aa  222  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  24.95 
 
 
1174 aa  222  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
896 aa  221  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.808684  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.16 
 
 
1088 aa  220  8.999999999999998e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.62 
 
 
1152 aa  220  8.999999999999998e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  30.82 
 
 
913 aa  220  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 
1140 aa  220  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.29 
 
 
1138 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  29.45 
 
 
1079 aa  218  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  27.31 
 
 
1147 aa  216  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1429  hypothetical protein  29.94 
 
 
910 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.98 
 
 
1172 aa  216  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  32.6 
 
 
935 aa  215  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  25.48 
 
 
1006 aa  215  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
1168 aa  214  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
917 aa  212  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  25.99 
 
 
1055 aa  212  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 
1323 aa  210  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  30.68 
 
 
1169 aa  207  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  30.15 
 
 
1100 aa  207  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
932 aa  207  9e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2061  Na+/solute symporter  28.82 
 
 
671 aa  207  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.274324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.54 
 
 
1145 aa  206  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 
1169 aa  206  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 
1159 aa  205  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  26.13 
 
 
1156 aa  202  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1145 aa  203  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 
1140 aa  201  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  31.32 
 
 
1145 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.44 
 
 
1167 aa  199  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
885 aa  197  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00597808  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 
1174 aa  197  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 
1169 aa  197  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.73 
 
 
1140 aa  196  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  24.63 
 
 
1141 aa  195  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 
1170 aa  195  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.18 
 
 
1185 aa  195  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 
1146 aa  194  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.47 
 
 
1111 aa  193  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 
1169 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>