More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_62530 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4694  multi-sensor signal transduction histidine kinase  82.29 
 
 
991 aa  1648    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000630671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4695  multi-sensor signal transduction histidine kinase  82.19 
 
 
991 aa  1646    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000969954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0965  sensor histidine kinase  80.98 
 
 
982 aa  1639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0832  PAS  80.84 
 
 
984 aa  1609    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253594 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.46 
 
 
987 aa  998    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  82.32 
 
 
982 aa  1634    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5442  two-component sensor CbrA  98.88 
 
 
983 aa  1966    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1029  two-component sensor CbrA  49.9 
 
 
986 aa  853    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211087  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  47.61 
 
 
1000 aa  898    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1893  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.44 
 
 
985 aa  816    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.426931  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42670  Sensory histidine protein kinase CbrA  76.98 
 
 
981 aa  1531    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416099  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  48.31 
 
 
975 aa  855    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62530  two-component sensor CbrA  100 
 
 
983 aa  1981    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 
981 aa  785    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000864337  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3588  two-component sensor kinase CbrA  82.99 
 
 
984 aa  1654    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.883039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  82.29 
 
 
991 aa  1649    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  hitchhiker  0.0000734254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0738  multi-sensor signal transduction histidine kinase  82.29 
 
 
991 aa  1654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000340339 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.29 
 
 
1323 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  27.56 
 
 
1323 aa  307  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  29.31 
 
 
1161 aa  307  7e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  28.27 
 
 
950 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 
1156 aa  289  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.11 
 
 
1159 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.5 
 
 
1171 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  26.61 
 
 
1157 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 
1159 aa  285  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.93 
 
 
1145 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  27.41 
 
 
1158 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27 
 
 
1159 aa  284  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  26.72 
 
 
1159 aa  283  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.64 
 
 
1158 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  27.83 
 
 
1147 aa  283  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  26.62 
 
 
1159 aa  283  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  30.42 
 
 
1083 aa  281  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  28.92 
 
 
1148 aa  280  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
917 aa  278  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.32 
 
 
1168 aa  278  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
932 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0715  Na+/solute symporter  33.5 
 
 
1039 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.723376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.82 
 
 
1172 aa  276  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.55 
 
 
1168 aa  275  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.9 
 
 
1169 aa  271  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
897 aa  271  5.9999999999999995e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.263667  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
1071 aa  269  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.565561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
893 aa  268  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194917  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  33.45 
 
 
1082 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  27.62 
 
 
1169 aa  267  7e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 
1169 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.67 
 
 
1088 aa  266  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.51 
 
 
1163 aa  266  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0169  Na+/solute symporter  31.68 
 
 
894 aa  266  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827667  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
894 aa  266  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.27583 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  37.26 
 
 
927 aa  265  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  27.27 
 
 
1174 aa  264  6e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.49 
 
 
1168 aa  264  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.03 
 
 
1179 aa  263  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
920 aa  263  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.28 
 
 
1174 aa  262  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2061  Na+/solute symporter  31.43 
 
 
671 aa  262  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.274324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.08 
 
 
1152 aa  261  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  33.68 
 
 
919 aa  260  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  25.95 
 
 
1006 aa  260  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.04 
 
 
1168 aa  260  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.13 
 
 
1172 aa  260  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  35.75 
 
 
1087 aa  259  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.76 
 
 
1167 aa  259  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  26.63 
 
 
1177 aa  258  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.6 
 
 
1175 aa  257  8e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 
1316 aa  257  9e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.72 
 
 
1138 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  35.68 
 
 
1087 aa  256  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.71 
 
 
1140 aa  255  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  34.42 
 
 
906 aa  254  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  33.39 
 
 
903 aa  254  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
896 aa  253  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.808684  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.77 
 
 
1140 aa  253  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  27.79 
 
 
1145 aa  252  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  32.83 
 
 
1079 aa  253  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  31.2 
 
 
935 aa  251  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
919 aa  250  9e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.24 
 
 
1159 aa  250  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1474  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
894 aa  248  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 
1161 aa  248  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.62 
 
 
1169 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  24.81 
 
 
1147 aa  245  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  26.87 
 
 
1156 aa  244  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1429  hypothetical protein  28.79 
 
 
910 aa  243  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.29 
 
 
1185 aa  240  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 
1152 aa  239  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  35.7 
 
 
913 aa  238  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
885 aa  237  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00597808  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  26.97 
 
 
1169 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 
1145 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.66 
 
 
1140 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 
1146 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.26 
 
 
1146 aa  235  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3419  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  24.3 
 
 
1184 aa  234  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  34.44 
 
 
1146 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 
1146 aa  233  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 
1146 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>