More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1029 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_42670  Sensory histidine protein kinase CbrA  50.1 
 
 
981 aa  877    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416099  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1893  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
985 aa  895    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.426931  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4695  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.04 
 
 
991 aa  879    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000969954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0965  sensor histidine kinase  49.23 
 
 
982 aa  880    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0832  PAS  49.22 
 
 
984 aa  857    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4694  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.09 
 
 
991 aa  870    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000630671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  49.12 
 
 
982 aa  860    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3588  two-component sensor kinase CbrA  49.33 
 
 
984 aa  865    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.883039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5442  two-component sensor CbrA  49.64 
 
 
983 aa  884    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1029  two-component sensor CbrA  100 
 
 
986 aa  1977    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211087  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0738  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.49 
 
 
991 aa  880    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000340339 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.19 
 
 
991 aa  877    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  hitchhiker  0.0000734254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.06 
 
 
987 aa  749    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  43.08 
 
 
1000 aa  752    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.57 
 
 
981 aa  1004    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000864337  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  50.1 
 
 
975 aa  904    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62530  two-component sensor CbrA  49.9 
 
 
983 aa  891    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0715  Na+/solute symporter  37.2 
 
 
1039 aa  360  7e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.723376  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 
1163 aa  340  7e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 
1171 aa  337  7.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 
1323 aa  335  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  30.59 
 
 
1174 aa  330  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  28.38 
 
 
1323 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  28.73 
 
 
1161 aa  325  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 
1168 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  28.82 
 
 
1169 aa  320  7e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  36.25 
 
 
919 aa  320  9e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.93 
 
 
1156 aa  320  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
917 aa  319  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  36.16 
 
 
903 aa  317  8e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  34.92 
 
 
927 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 
1174 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 
1169 aa  313  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
894 aa  312  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.27583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  29.92 
 
 
1159 aa  312  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0169  Na+/solute symporter  34.28 
 
 
894 aa  312  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  29.82 
 
 
1159 aa  311  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
919 aa  310  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.83 
 
 
1167 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  29.76 
 
 
1157 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
897 aa  307  8.000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.263667  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 
1169 aa  307  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1474  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
894 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  29.29 
 
 
1169 aa  304  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.01 
 
 
1169 aa  304  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
932 aa  303  7.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.84 
 
 
1159 aa  302  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.84 
 
 
1159 aa  302  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.69 
 
 
1158 aa  301  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 
1158 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 
1159 aa  300  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  33.48 
 
 
906 aa  300  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 
1170 aa  300  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  32.93 
 
 
1082 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 
1168 aa  295  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  33.28 
 
 
1087 aa  293  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.68 
 
 
1172 aa  292  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  33.33 
 
 
1087 aa  291  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  27.9 
 
 
1177 aa  291  5.0000000000000004e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  27.19 
 
 
1006 aa  291  5.0000000000000004e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
896 aa  290  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.808684  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
920 aa  289  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 
1169 aa  289  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 
1185 aa  289  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2061  Na+/solute symporter  33.28 
 
 
671 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.274324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  36.21 
 
 
1079 aa  288  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  28.37 
 
 
1148 aa  287  5e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 
1145 aa  287  9e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  28.38 
 
 
1147 aa  286  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.19 
 
 
1088 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.89 
 
 
1168 aa  286  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1429  hypothetical protein  32.25 
 
 
910 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  35.89 
 
 
935 aa  285  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
893 aa  284  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194917  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
1071 aa  284  6.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.565561 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  31.33 
 
 
1083 aa  283  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  39.7 
 
 
913 aa  282  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  33.77 
 
 
950 aa  282  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 
1316 aa  278  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 
1152 aa  277  9e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 
1168 aa  272  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  28.87 
 
 
1150 aa  271  5.9999999999999995e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 
1168 aa  269  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 
1177 aa  268  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  25.91 
 
 
1147 aa  268  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
1070 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308131  normal  0.537019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 
1172 aa  265  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.11 
 
 
1175 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.54 
 
 
1152 aa  264  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
945 aa  263  8.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  27.08 
 
 
1145 aa  263  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
901 aa  262  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.79 
 
 
1156 aa  261  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
1069 aa  261  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.095908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
1069 aa  261  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3419  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.57 
 
 
1184 aa  259  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.37 
 
 
1159 aa  259  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 
1070 aa  259  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.16 
 
 
1179 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 
1145 aa  255  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>