More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_42670 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1893  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 
985 aa  783    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.426931  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  78.69 
 
 
991 aa  1568    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  hitchhiker  0.0000734254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4695  multi-sensor signal transduction histidine kinase  78.79 
 
 
991 aa  1571    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000969954 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54 
 
 
987 aa  967    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0965  sensor histidine kinase  79 
 
 
982 aa  1587    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0832  PAS  79 
 
 
984 aa  1561    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253594 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  79 
 
 
982 aa  1561    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0738  multi-sensor signal transduction histidine kinase  79 
 
 
991 aa  1577    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000340339 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.84 
 
 
981 aa  755    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000864337  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5442  two-component sensor CbrA  77.29 
 
 
983 aa  1544    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3588  two-component sensor kinase CbrA  79.98 
 
 
984 aa  1596    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.883039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4694  multi-sensor signal transduction histidine kinase  78.59 
 
 
991 aa  1565    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000630671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42670  Sensory histidine protein kinase CbrA  100 
 
 
981 aa  1981    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416099  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  46.53 
 
 
1000 aa  877    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1029  two-component sensor CbrA  50.1 
 
 
986 aa  847    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211087  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  47.45 
 
 
975 aa  829    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62530  two-component sensor CbrA  76.98 
 
 
983 aa  1542    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  27.56 
 
 
1161 aa  287  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.23 
 
 
1323 aa  287  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
894 aa  281  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.27583 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0169  Na+/solute symporter  31.95 
 
 
894 aa  281  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  26.63 
 
 
950 aa  278  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0715  Na+/solute symporter  31.82 
 
 
1039 aa  270  8e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.723376  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  26.25 
 
 
1006 aa  270  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
893 aa  266  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194917  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.22 
 
 
1156 aa  266  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  27.41 
 
 
1148 aa  265  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  24.74 
 
 
1157 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.42 
 
 
1145 aa  263  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  28.74 
 
 
1083 aa  261  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  26.02 
 
 
1158 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 
1171 aa  260  9e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
917 aa  260  9e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1474  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
894 aa  260  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  27.59 
 
 
903 aa  259  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
897 aa  258  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.263667  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.81 
 
 
1159 aa  258  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  26.7 
 
 
1174 aa  257  6e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  26.13 
 
 
1159 aa  257  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  26.13 
 
 
1159 aa  257  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 
1158 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 
1071 aa  255  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.565561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.93 
 
 
1159 aa  255  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 
1159 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
932 aa  254  7e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.86 
 
 
1163 aa  254  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 
1175 aa  254  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 
1168 aa  252  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.83 
 
 
1167 aa  252  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  33.4 
 
 
1082 aa  252  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  26.94 
 
 
1147 aa  252  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 
1172 aa  251  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.91 
 
 
1168 aa  250  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
896 aa  249  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.808684  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.05 
 
 
1152 aa  249  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.27 
 
 
1168 aa  248  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
920 aa  248  6e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.81 
 
 
1168 aa  246  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  26.19 
 
 
1177 aa  246  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  34.61 
 
 
927 aa  246  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.37 
 
 
1174 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  26.72 
 
 
1179 aa  245  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.96 
 
 
1138 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.46 
 
 
1152 aa  243  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
919 aa  243  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 
1316 aa  243  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  26.36 
 
 
1169 aa  242  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  28.8 
 
 
1323 aa  241  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  34.9 
 
 
1087 aa  239  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  32.31 
 
 
935 aa  238  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.95 
 
 
1172 aa  238  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.19 
 
 
1088 aa  237  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.95 
 
 
1169 aa  237  7e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2061  Na+/solute symporter  30.62 
 
 
671 aa  237  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.274324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  33.48 
 
 
906 aa  237  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  31.36 
 
 
919 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  31.84 
 
 
913 aa  234  9e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  34.19 
 
 
1087 aa  233  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1429  hypothetical protein  31.22 
 
 
910 aa  233  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
885 aa  232  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00597808  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  31.13 
 
 
1079 aa  232  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.87 
 
 
1169 aa  230  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 
945 aa  226  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  24.91 
 
 
1145 aa  224  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  33.7 
 
 
1150 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  26.44 
 
 
1147 aa  222  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.8 
 
 
1140 aa  222  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  26.03 
 
 
1169 aa  222  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 
1170 aa  218  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  26.16 
 
 
1156 aa  217  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.64 
 
 
1146 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
1070 aa  214  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308131  normal  0.537019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.84 
 
 
1169 aa  214  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  25.14 
 
 
1142 aa  213  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.07 
 
 
1159 aa  211  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  23.31 
 
 
1185 aa  211  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.57 
 
 
1146 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  31.17 
 
 
1100 aa  209  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  24.46 
 
 
1055 aa  209  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.26 
 
 
1146 aa  208  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>