More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5574 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  69.71 
 
 
627 aa  773    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  69.71 
 
 
627 aa  773    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  69.36 
 
 
627 aa  769    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  97.87 
 
 
611 aa  1165    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  86.96 
 
 
602 aa  972    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  69.71 
 
 
627 aa  773    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  89.47 
 
 
589 aa  1019    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  69.71 
 
 
627 aa  773    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
611 aa  1237    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  69.57 
 
 
626 aa  778    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  85.86 
 
 
594 aa  983    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  69.71 
 
 
627 aa  773    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
611 aa  1237    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  69.71 
 
 
627 aa  773    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  63.83 
 
 
358 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  63.83 
 
 
389 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  63.83 
 
 
389 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  63.83 
 
 
358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  63.83 
 
 
389 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  63.83 
 
 
389 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  63.53 
 
 
389 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  63.83 
 
 
358 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  60.59 
 
 
681 aa  333  6e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  54.83 
 
 
305 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  57.04 
 
 
1187 aa  320  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  50.47 
 
 
470 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  55 
 
 
445 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.83 
 
 
553 aa  310  5e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  55.16 
 
 
406 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  53.9 
 
 
408 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  53.9 
 
 
408 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  54.51 
 
 
467 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.27 
 
 
1021 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
467 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  50 
 
 
505 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  60 
 
 
689 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528175  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2102  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  58.85 
 
 
689 aa  286  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.762889  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  53.01 
 
 
524 aa  286  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.41 
 
 
1465 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4735  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  64.23 
 
 
689 aa  282  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0595206  normal  0.234911 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.88 
 
 
1146 aa  279  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.83 
 
 
679 aa  279  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  46.75 
 
 
439 aa  278  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.36 
 
 
392 aa  278  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1200  sensor histidine kinase  51.77 
 
 
471 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0802  EAL/GGDEF domain-containing protein  58.69 
 
 
688 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0664  EAL/GGDEF domain-containing protein  58.69 
 
 
688 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0241577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1106  diguanylate cyclase/cyclic diguanylate phosphodiesterase  58.69 
 
 
688 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.804569  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1766  EAL/GGDEF domain-containing protein  58.69 
 
 
688 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.356944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2392  EAL/GGDEF domain-containing protein  58.69 
 
 
688 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278752  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0788  sensor histidine kinase  51.77 
 
 
465 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105833  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.61 
 
 
683 aa  265  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0677  sensor histidine kinase  51.92 
 
 
538 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.755053  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1182  GGDEF domain/EAL domain-containing protein  58.3 
 
 
688 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1588  sensor histidine kinase  49.24 
 
 
502 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153224  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1123  sensor histidine kinase  51.6 
 
 
471 aa  263  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2403  sensor histidine kinase  51.45 
 
 
601 aa  263  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  47.45 
 
 
310 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.22 
 
 
683 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 
713 aa  257  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  39.81 
 
 
730 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2545  sensor histidine kinase  44 
 
 
429 aa  247  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 
678 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  39.17 
 
 
1780 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  39.62 
 
 
708 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  42.23 
 
 
308 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
468 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3608  sensor histidine kinase  44.49 
 
 
313 aa  234  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
566 aa  233  9e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  39.87 
 
 
724 aa  233  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49140  GGDEF domain protein  50.17 
 
 
689 aa  231  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3474  histidine kinase  36.95 
 
 
449 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  37.85 
 
 
1808 aa  230  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  38.73 
 
 
1811 aa  229  9e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  39.36 
 
 
1795 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
766 aa  229  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
715 aa  228  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0401  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with MHYT sensor  53.78 
 
 
687 aa  227  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.465852 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
594 aa  226  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
440 aa  226  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3259  sensor histidine kinase  42.25 
 
 
598 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408532  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
585 aa  225  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3579  hypothetical protein  55.06 
 
 
685 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0227937  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
699 aa  224  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  40.28 
 
 
468 aa  223  9e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 
971 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42220  membrane sensor domain-containing protein  54.69 
 
 
685 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  38.96 
 
 
468 aa  220  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
557 aa  219  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
680 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26810  putative two-component sensor  41.81 
 
 
371 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
688 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  41 
 
 
433 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  39.02 
 
 
726 aa  217  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0658  sensor histide kinase  40.67 
 
 
315 aa  217  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
494 aa  217  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
641 aa  217  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  35.85 
 
 
1850 aa  216  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0510  hypothetical protein  54 
 
 
701 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0522945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2525  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  46.23 
 
 
693 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>